Pseudouridin (Ψ) je C-glikozidni izomer nukleozida uridina. On je najprevalentniji iz grupe od preko sto različitih nukleozida nađenih u RNK.[3] Ψ je prisutan kod svih vrsta i u mnogim klasama RNK izuzev iRNK.[4][5] Ψ formiraju enzimi Ψ sintaze, koji posttranskripciono izomerizuju specifične uridinske ostatke u RNK u procesu pseudouridilacije.[6]

Pseudouridin
Nazivi
IUPAC naziv
5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-Dihidroksi-5-(hidroksimetil)-oksolan-2-il]-1H-pirimidin-2,4-dion
Preferisani IUPAC naziv
5-(β-D-ribofuranozil)pirimidin-2,4(1H,3H)-dion
Drugi nazivi
psi-uridin, 5-Riboziluracil, beta-D-pseudouridin, 5-(beta-D-ribofuranozil)uracil
Identifikacija
3D model (Jmol)
ChEBI
ChemSpider
  • O=C1N\C=C(/C(=O)N1)[C@@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]2O
Svojstva
C9H12N2O6
Molarna masa 244,20 g/mol
Agregatno stanje Beli granularni prah
Visoko rastvoran u vodi
Ukoliko nije drugačije napomenuto, podaci se odnose na standardno stanje materijala (na 25 °C [77 °F], 100 kPa).
ДаY verifikuj (šta je ДаYНеН ?)
Reference infokutije

Nedavna istraživanja sugeriraju da on možda daje izvesnu zaštitu od radijacije.[7]

On se često javlja u tRNK, u asocijaciji sa timidinom i citozinom u TΨC ruci i jedan je od nepromenljivih regiona tRNK. Njegova funkcija nije potpuno razjašnjena. Smatra se da učestvuje u asocijaciji sa aminoacil transferazom tokom interakcije sa tRNK, i otuda u inicijaciji translacije.

Pseudouridin se biosintetiše iz uridina posredstvom Ψ sintaze

Reference уреди

  1. ^ Li Q, Cheng T, Wang Y, Bryant SH (2010). „PubChem as a public resource for drug discovery.”. Drug Discov Today. 15 (23-24): 1052—7. PMID 20970519. doi:10.1016/j.drudis.2010.10.003.  уреди
  2. ^ Evan E. Bolton; Yanli Wang; Paul A. Thiessen; Stephen H. Bryant (2008). „Chapter 12 PubChem: Integrated Platform of Small Molecules and Biological Activities”. Annual Reports in Computational Chemistry. 4: 217—241. doi:10.1016/S1574-1400(08)00012-1. 
  3. ^ Hamma T, Ferré-D'Amaré AR (2006). „Pseudouridine synthases”. Chem. Biol. 13 (11): 1125—1135. PMID 17113994. doi:10.1016/j.chembiol.2006.09.009. 
  4. ^ Charette M, Gray MW (2000). „Pseudouridine in RNA: what, where, how, and why”. IUBMB Life. 49 (5): 341—351. PMID 10902565. doi:10.1080/152165400410182. 
  5. ^ Liang XH, Xu YX, MIchaeli S (2002). „The spliced leader-associated RNA is a trypanosome-specific sn(o) RNA that has the potential to guide pseudouridine formation on the SL RNA”. RNA. 8 (2): 237—246. PMC 1370245 . PMID 11911368. doi:10.1017/S1355838202018290. 
  6. ^ Ferré-D'Amaré AR (2003). „RNA-modifying enzymes”. Curr. Opin. Struct. Biol. 13 (1): 49—55. PMID 12581659. doi:10.1016/S0959-440X(02)00002-7. 
  7. ^ Monobe, Manami; Arimoto-Kobayashi, Sakae; Ando, Koichi (2003). „β-Pseudouridine, a beer component, reduces radiation-induced chromosome aberrations in human lymphocytes”. Mutation research. Genetic toxicology and environmental mutagenesis. 538 (1–2): 93—99. PMID 12834758. doi:10.1016/S1383-5718(03)00094-9. Архивирано из оригинала 15. 09. 2009. г. Приступљено 22. 06. 2012. 

Vidi još уреди

Spoljašnje veze уреди