Протеинска фамилија
Протеинска фамилија је група еволуционо-повезаних протеина.[1] Овај термин је ћесто синониман са термином генска фамилија. Термин протеинска фамилија не треба поистовећивати са фамилијом која се користи у таксономији.
Протеини једне фамилије потичу од заједничког претходника (и.е. они су хомологни) и типично имају сличне три-димензиона структуре, функције, и знатну сличност секвенци. Иако је тешко проценити значај функционалних или структурних сличности, постоји прилично добро развијен оквир за процену значаја сличности између група секвенци користећи методе поравнавања секвенци. За протеине који не деле заједничког претка постоји врло мала вероватноћа да ће показати статистички значајану сличност секвенци. Из тог разлога је поравнавање секвенци моћно оруђе за идентификацију чланова протеинских фамилија.[2]
Тренутно је преко 60,000 протеинских фамилија дефинисано[3], мада двосмисленост у дефиницији протеинске фамилије доводи различите истраживаче до знатно различитих бројева.
Види још уреди
Референце уреди
- ^ Вогел C, Цхотхиа C (2006). „Протеин фамилy еxпансионс анд биологицал цомплеxитy”. ПЛоС Цомпутатионал Биологy. 2 (5): е48. ПМЦ 1464810
. ПМИД 16733546. дои:10.1371/јоурнал.пцби.0020048.
- ^ Оуеллетте, Б. Ф. Францис; Баxеванис, Андреас D. (2005). Биоинформатицс: а працтицал гуиде то тхе аналyсис оф генес анд протеинс. Неw Yорк: Wилеy-Интерсциенце. ИСБН 0-471-47878-4.
- ^ Кунин V, Цасес I, Енригхт АЈ, де Лорензо V, Оузоунис ЦА (2003). „Мyриадс оф протеин фамилиес, анд стилл цоунтинг”. Геноме Биологy. 4 (2): 401. ПМЦ 151299 . ПМИД 12620116.[мртва веза]
Литература уреди
- Оуеллетте, Б. Ф. Францис; Баxеванис, Андреас D. (2005). Биоинформатицс: а працтицал гуиде то тхе аналyсис оф генес анд протеинс. Неw Yорк: Wилеy-Интерсциенце. ИСБН 0-471-47878-4.
