Трансмембрански домен

Трансмембрански домен најчешће означава трансмембрански алфа хеликс трансмембранског протеина. Он се назива доменом зато што алфа-хеликс у мембрани може бити савијен независно од остатка протеина, слично доменима у води растворних протеина. У ширем смислу, трансмембрански домен је свака три-димензиона протеинска структура која је термодинамички стабилна у мембрани. То може да буде један алфа хеликс, стабилни комплекс неколико трансмембранских алфа хеликса, трансмембрански бета барел, бета-хеликс грамицидина А, или нека друга структура.

Трансмембрански протеини у липидном двослоју. Границе хидрофобног липидног угљоводоничног језгра су означене равнима. Неполарни остаци протеина су изложени у овој средини.

Трансмембрански хеликси најчешће садрже 20 аминокиселина, мада они могу бити много дужи или краћи.

Идентификација трансмембранских хеликса

Трансмембрански хеликси су видљиви у структурама мембранских протеина одређених дифракцијом X-зрака. Они се могу предвидети на основу скала хидрофобности. Зато што су унутрашњост двослоја и већине трансмембранских протеина познатих структура хидрофобне, сматра се је предуслов за амино киселине које премоштавају мембране да су такође хидрофобне. Међутим, мембранске пумпе и јонски канали такође садрже бројне наелектрисане и поларне остатке са генерално неполарним трансмембранским сегментима.

Види још

• Г протеин спрегнути рецептори

Додатна литература

• Партридге АW, Лиу С, Ким С, Боwие ЈУ, Гинсберг МХ (2005). „Трансмембране домаин хелиx пацкинг стабилизес интегрин алпхаИИббета3 ин тхе лоw аффинитy стате”. Тхе Јоурнал оф Биологицал Цхемистрy. 280 (8): 7294—300. ПМИД 15591321. дои:10.1074/јбц.М412701200. 
• Ли Р, Беннетт ЈС, Деградо WФ (2004). „Струцтурал басис фор интегрин алпхаИИббета3 цлустеринг”. Биоцхемицал Социетy Трансацтионс. 32 (Пт3): 412—5. ПМИД 15157149. дои:10.1042/БСТ0320412. 

Спољашње везе

• Expasy Архивирано на веб-сајту Wayback Machine (10. август 2011)