Трансмембрански домен

Трансмембрански домен најчешће означава трансмембрански алфа хеликс трансмембранског протеина[1]. Он се назива доменом зато што алфа-хеликс у мембрани може бити савијен независно од остатка протеина, слично доменима у води растворних протеина. У ширем смислу, трансмембрански домен је свака три-димензиона протеинска структура која је термодинамички стабилна у мембрани. То може да буде један алфа хеликс, стабилни комплекс неколико трансмембранских алфа хеликса, трансмембрански бета барел, бета-хеликс грамицидина А[2], или нека друга структура.[3]

Трансмембрански протеини у липидном двослоју. Границе хидрофобног липидног угљоводоничног језгра су означене равнима. Неполарни остаци протеина су изложени у овој средини.

Трансмембрански хеликси најчешће садрже 20 аминокиселина, мада они могу бити много дужи или краћи.[1]

Идентификација трансмембранских хеликса уреди

Трансмембрански хеликси су видљиви у структурама мембранских протеина одређених дифракцијом X-зрака. Они се могу предвидети на основу скала хидрофобности. Зато што су унутрашњост двослоја и већине трансмембранских протеина познатих структура хидрофобне, сматра се је предуслов за амино киселине које премоштавају мембране да су такође хидрофобне. Међутим, мембранске пумпе и јонски канали такође садрже бројне наелектрисане и поларне остатке са генерално неполарним трансмембранским сегментима.

Види још уреди

Референце уреди

  1. ^ а б Бранден C; Тоозе Ј. Интродуцтион то Протеин Струцтуре. Неw Yорк, НY: Гарланд Публисхинг. ИСБН 0-8153-2305-0. 
  2. ^ Буркхарт БМ, Гассман РМ, Лангс ДА, Пангборн WА, Дуаx WЛ, Плетнев V (1999). „Грамицидин D цонформатион, дyнамицс анд мембране ион транспорт”. Биополyмерс. 51 (2): 129—44. ПМИД 10397797. дои:10.1002/(СИЦИ)1097-0282. 
  3. ^ Бруце Албертс; Алеxандер Јохнсон; Јулиан Леwис; Мартин Рафф; Кеитх Робертс; Петер Wалтер (2002). Молецулар Биологy оф тхе Целл. Неw Yорк: Гарлард Сциенце. ISBN 0815332181. 

Литература уреди

Додатна литература уреди

Спољашње везе уреди