Rita Kasadio (engl. Rita Casadio) je vanredna profesorka Odeljenja za farmaciju i biotehnologiju Univerziteta u Bolonji.[1][2]

Rita Kasadio
Mesto rođenjaItalija
Veb-sajtwww.biocomp.unibo.it/casadio/

Biografija uredi

Diplomirala je na Univerzitetu u Bolonji nakon čega je pohađala nekoliko kurseva u Italiji i inostranstvu i stekla iskustvo iz različitih oblasti kao što su računarstvo, biofizika membrana i proteina, bioenergetika i termodinamika.[3] Nakon rada u laboratorijama za biofiziku u Sjedinjenim Američkim Državama i u Nemačkoj 1987. godine je postala docent biofizike na Univerzitetu u Bolonji.[3] Od 1. oktobra 2001. je redovni profesor biohemije, uglavnom se bavi oblastima biofizike membrana i proteina.[3] Od 2011. godine je profesor na Univerzitetu u Šangaju.[3] Trenutno radi na kompjuterskom modeliranju relevantnih bioloških procesa kao što su preklapanje proteina i modeliranje njihove stabilnosti i interakcija. Jedno od glavnih polja njenih istraživanja je primena metoda mašinskog učenja za predviđanje sekundarne i tercijarne strukture proteina iz njihovih sekvenci aminokiselinskih ostataka, posebno membranskih proteina i njihove transmembranske topologije. Radi kao rukovodilac Centra za biotehnološka istraživanja Univerziteta u Bolonji i njena istraživanja su posvećena različitim aspektima modeliranja proteina, uključujući predviđanje sekundarnih i tercijarnih struktura sa neuronskim mrežama, genetski algoritmi, molekularno spajanje, mehanizmi proteinske reakcije i novi dizajn spiralnih peptida.[3] Autorka je oko trista naučnih radova i prezentovala je svoj rad na više od trista domaćih i međunarodnih skupova.[3] Njen rad u mašinskom učenju je korišćen za predviđanje strukture proteina, a metode iz njene grupe su visoko rangirane na međunarodnim takmičenjima kao što su Kritička procena predviđanja strukture proteina (CASP) i Kritička procena anotacije funkcije (CAFA).[4][5][6][7] Organizovala je međunarodne škole bioinformatike, bila je kopredsedavajući WABI 2005, u uređivačkom je odboru BMC bioinformatike i rudarenja biopodataka, bila je predsednica Bolonjskog međunarodnog mastera za bioinformatiku 2007—20015, bila je član upravnog odbora I.N.B.B, italijanskog međuuniverzitetskog konzorcijuma u svojstvu predstavnika italijanskog ministra MIUR-a, Međunarodnog društva za računarsku biologiju i Italijanskog društva za bioinformatiku.[3] Dopisni je član Akademije nauke Instituta u Bolonji.[3] Izabrana je za člana Međunarodnog društva za računarsku biologiju (ISCB) 2020. godine za izuzetan doprinos u oblastima računarske biologije i bioinformatike.[8]

Reference uredi

  1. ^ Griffin, Martin; Casadio, Rita; Bergamini, Carlo M. (2002). „Transglutaminases: Nature's biological glues”. Biochemical Journal. 368 (2): 377—396. ISSN 0264-6021. PMC 1223021 . PMID 12366374. doi:10.1042/bj20021234. 
  2. ^ Capriotti, E.; Fariselli, P.; Casadio, R. (2005). „I-Mutant2.0: predicting stability changes upon mutation from the protein sequence or structure”. Nucleic Acids Research. 33 (Web Server): W306—W310. ISSN 0305-1048. PMC 1160136 . PMID 15980478. doi:10.1093/nar/gki375. 
  3. ^ a b v g d đ e ž „Rita Casadio — University of Bologna — Home Page”. www.unibo.it. Pristupljeno 2023-03-07. 
  4. ^ Anon (2020). „ISCB Fellows”. iscb.org. International Society for Computational Biology. Arhivirano iz originala 20. 03. 2017. g. Pristupljeno 07. 03. 2023. 
  5. ^ Radivojac, Predrag; Clark, Wyatt T; Oron, Tal Ronnen; Schnoes, Alexandra M; Wittkop, Tobias; Sokolov, Artem; Graim, Kiley; et al. (2013). „A large-scale evaluation of computational protein function prediction”. Nature Methods. 10 (3): 221—227. ISSN 1548-7091. PMC 3584181 . PMID 23353650. doi:10.1038/nmeth.2340. 
  6. ^ Rost, Burkhard; Sander, Chris; Casadio, Rita; Fariselli, Piero (2008). „Transmembrane helices predicted at 95% accuracy”. Protein Science. 4 (3): 521—533. ISSN 0961-8368. PMC 2143072 . PMID 7795533. doi:10.1002/pro.5560040318. 
  7. ^ Rost, Burkhard; Fariselli, Piero; Casadio, Rita (1996). „Topology prediction for helical transmembrane proteins at 86% accuracy-Topology prediction at 86% accuracy”. Protein Science. 5 (8): 1704—1718. ISSN 0961-8368. PMC 2143485 . PMID 8844859. doi:10.1002/pro.5560050824. 
  8. ^ Anon (2020). „ISCB Congratulates and Introduces the 2020 Class of Fellows!”. iscb.org. International Society for Computational Biology.