== Критике ЦАНУ и однос државе Црне Горе према академији ==
Критичари ЦАНУ оптужују као просрпску институцију, првенствено због њене историјске школе која одступа од дукљано-монтенегринскецрногорске дисциплине и која Црногорце сматра нацијом српског етничког поријекла и најближе Србима. Критичарима Црногорске академије наука и умјетности смета и то што је претходни предсједник ЦАНУ др Драгутин Вукотић био Србин, али и став ЦАНУ да изрази отпор формирању [[Црногорски језик|црногорског језика]], остајући при ставу да је матерњи језик Црногораца српски језик.<ref>{{Cite web |url=http://www.pobjeda.co.me/citanje.php?datum=2007-06-01&id=119208 |title=Arhiva - Pobjeda Dnevni List{{Ботовски наслов}} |access-date=30. 01. 2011 |archive-url=https://web.archive.org/web/20111007064930/http://www.pobjeda.co.me/citanje.php?datum=2007-06-01&id=119208 |archive-date=07. 10. 2011 |url-status=dead |df= }}</ref> Због ових оптужби, у Црној Гори долази до подвојености научне заједнице и формирања удружења грађана под називом [[Дукљанска академија наука и умјетности]] као антитеза званичној црногорској академији. ЦАНУ је често на удару црногорских националиста због њене незаинтересованости за активније учешће у борби за национално признање Црногораца и црногорске суверености, која је задобијена на референдуму 2006. године.
Садашњем предсједнику ЦАНУ, др Момиру Ђуровићу, критичари замјерају и то што се 2007. године, након доношења новог Устава Црне Горе, којим је умјесто дотад српског језика за званични језик Црне Горе проглашен црногорски, сретао са једним од лидера просрпске опозиције [[Андрија Мандић|Андријом Мандићем]]. Због овог, Ђуровић је био изложен јавном вређању од стране неких монтенегринскихцрногорских историчара.<ref>[http://www.slobodnaevropa.org/content/crna_gora_sud_mizerija/1873300.html Andrijašević: Nisam vrijeđao predsjednika CANU{{Ботовски наслов}}]</ref>
Године 2008. након одлуке црногорских власти о признању једностране проглашене независности Косова од Србије, ЦАНУ је оштро осудила овај акт власти, због чега је опет била изложена вријеђању и академија и њен предсједник.
