Стоун је режирао ''[[Потпуни заокрет]]'' (1997) и ''-{[[Any Given Sunday]]}-'' (1999), филм о борби за власт унутар и око тима америчког фудбала. Године 2000, Стоун се са [[Чарли Шин|Чарлијем Шином]] и Мајклом Дагласом појавио у ''-{Money Never Sleeps}-''. Филм је документарац о снимању филма -{Wall''[[Вол Street}-стрит (филм)|Вол стрит]]'' (1987) који је Стоун режирао, а у којем су се Шин и Даглас појавили. Стоун је такође режирао филм ''[[Александар (филм)|Александар]]'' (2004), биографски филм о [[Александар Велики|Александру Великом]]. Након „Александра“''Александра'' Стоун је режисираорежирао фиомфилм ''-{World Trade Center}-'', у чијем средишту су двојица -{Port Authority Police Department}- (-{PAPD}-) полицајаца током [[Напади 11. септембра 2001.|напада 11. септембра]]. Стоун је настојао да режира четврти филм о Вијетнамском рату, ''-{Pinkville}-'', који приказује истрагу око [[масакр у Ми Лају|масакра вијетнамских цивила у Ми Лају]]. Стоун је написао, продуцирао и режирао биографски филм о [[Џорџ В. Буш|Џорџу В. Бушу]], названог „-{W.}-“''[[Буш (филм)|Буш]]''. НаговијестиоНаговестио је да се у филму бави контроверзним предсједниковимпредседниковим дјетињствомдетињством, везом са оцем, борбом са алкохолизмом, поновним открићем његове хришћанске вјеревере, и његовим личним животом до [[инвазија на Ирак (2003)|инвазије на Ирак 2003. године]]. Филм је базиран на сценарију који је написао са Стенлијем Вејсером, са којим је заједно написао и -{Wall''Вол Street}-стрит'' (1987). [[Џош Бролин]] је глумиотумачио унасловну насловној улозиулогу, [[Џејмс Кромвел]] се појавио као [[Џорџ ХербертХ. ВокерВ. Буш]] и [[Елизабет Бенкс]] као Лаура Велч[[Лора Буш]]. Филм је премијерно приказан 18. октобра 2008, три мјесецамесеца пријепре инаугурације [[Барак Обама|Барака Обаме]].
Снимио је „''[[Вол Стритстрит: новацНовац никад не спава]]”'' 2010, својеврсни наставак филма „[[''Вол Стрит (филм)|Вол Стрит]]”стрит'', а потом и кримић „''[[Дивљаци (филм)|Дивљаци]]”'' (''-{Savages}-'' 2012). Биографски филм о [[Едвард Сноуден|Едварду Сноудену]] једноставног назива „''[[Сноуден (филм)|Сноуден]]”'' приказан је 2016. године.
У периоду од јула 2015. до фебруара 2017. начинио је серију интервјуа са руским председником [[Владимир Путин|Владимиром Путином]]. Разговори су приказани у виду четвороделног документарног филма „''[[Интервјуи са Путином]]”'', који је премијерно приказан од 12. до 15. јуна 2017. на америчком кабловском каналу [[Шоутајм]].
