Геномика — разлика између измена

Садржај обрисан Садржај додат
Нема описа измене
Спашавам 1 извора и означавам 0 мртвим.) #IABot (v2.0.8
Ред 49:
Illumina секвенцирање је метода која се заснива на коришћењу обојених реверзибилних терминатора се на реверзибилним терминаторима бојила. Развијена је 1996. године на Институту за биомедицинска истраживања у Женеви од стране Паскала Мајера и Лаурента Фаринелија.<ref>Kawashima EH, Farinelli L, Mayer P (12 May 2005). [https://patents.google.com/patent/US20050100900 "Method of nucleic acid amplification"]. Retrieved 2012-12-22.</ref> Кораци у овој методи јесу фрагментисање молекула ДНК и везивања адаптера за крајеве фрагмената. Фрагменти се затим наливају на стаклене проточне ћелије на којима се налази велики број олигонуклеотида који су комеплементарни адаптерима за које се и везују. Оба адаптера хибридузују са нукеотидима и тако се формира мост након чега следи амплификација фрагмената чиме се добијају кластери (велики број фрагмената-копија једног почетног фрагмента). Проточна ћелија се ставља у апарат за секвенцирање и додају јој се ДНК полимераза и флуоресцентно обојени терминатори, нуклеотиди који имају интктивирану 3'-OH групу што омогућава да након уградње ових нуклеотида полимераза не може да настави са додавањем нуклеотида (синтезом ланца) па се ласером у сваком циклусу детектује боја и тиме одговарајући нуклеотид.<ref name=":1" /> Након сваке рунде се хемијском реакцијом уклања обележени терминатор и наставља са процесом секвенцирања.<ref>{{Cite web|url=https://web.archive.org/web/20130518193940/http://www.lcg.unam.mx/frontiers/files/frontiers/annurev.genom.9.081307.164359.pdf|title=Wayback Machine|date=2013-05-18|website=web.archive.org|access-date=2021-06-01}}</ref> Софтвер показује секвенцу сваког појединачног кластера.
 
Алтернативни приступ заснован је на хемији репликације ДНК. Ова технологија мери ослобађање јона водоника сваки пут када се угради база током полимеризације ДНК. Микробунар који садржи ДНК ланац за секвенцирање преплављен је једном врстом деоксирибонуклеотид трифосфата (dNTP). Ако је уведени dNTP комплементаран са темплејтом (секвенцом ДНК), биће уграђен у растући комплементарни ланац и ово узрокује ослобађање јона водоника који бележи јонски сензор.<ref name="davies1">{{Cite journal|year=2011|title=Powering Preventative Medicine|url=http://www.bio-itworld.com/issues/2011/sept-oct/powering-preventative-medicine.html|journal=Bio-IT World|issue=September–October|access-date=29. 05. 2021|archive-date=06. 06. 2016|archive-url=https://web.archive.org/web/20160606115325/http://www.bio-itworld.com/issues/2011/sept-oct/powering-preventative-medicine.html|url-status=dead}}</ref>
 
=== Асемблирање генома ===