Бојл је рођен у замку [[Lismore Castle|ЛисморЛизмор]], у округу [[County Waterford|Вотерфорд]], у Ирској, као седми син и четрнаесто дете [[Richard Boyle, 1st Earl of Cork|првог грофа од Корка]] (''Великог грофа од Корка'') и [[Catherine Fenton Boyle|Катрин Фентон]].<ref name=EB1911/> Лорд Корк, тада познат једноставно као Ричард Бојл, стигао је у [[Dublin|Даблин]] из Енглеске 1588. за време [[Tudor dynasty|Тјудорских]] [[plantations of Ireland|плантажа у Ирској]] и добио именовање као заменик [[escheator|ешеатора]]. Стекао је огромно богатство и поседе до времена када је Роберт рођен, и постао је [[Earl of Cork|гроф од Корка]] у октобру 1620. Катрин Фентон, [[Countess|грофица]] од [[County Cork|Корка]], била је ћерка сер [[Sir Geoffrey Fenton|Џефрија Фентона]], бившег [[Secretary of State (Ireland)|државног секретара за Ирску]], који је рођен у Даблину 1539. и Алис Вестон, ћерке [[Robert Weston|Роберта Вестона]], која је рођена у [[Lismore, County Waterford|ЛисморуЛизмору]] 1541. године.<ref>{{Citation|title=Catherine Fenton|work=Family Ghosts|url=http://www.stanford.edu/group/auden/cgi-bin/auden/individual.php?pid=I4234&ged=auden-bicknell.ged |access-date=9 June 2011}}</ref>
Као дете, Бојла је одгајала [[wet nurse|дојиља]],<ref name=McCartneyWhitaker>{{citation|title=Physicists of Ireland: Passion and Precision|first1=Mark|last1=McCartney|first2=Andrew|last2=Whitaker|publisher=Institute of Physics Publishing|year=2003|location=London}}</ref> као и његову старију браћу. Бојл је похађао приватну наставу латинског, грчког и француског језика, а када је имао осам година, након смрти мајке, он и његов брат Френсис су послати на [[Eton College|Итон колеџ]] у Енглеској. Пријатељ његовог оца, сер [[Sir Henry Wotton|Хенри Вотон]], тада је био [[Provost (education)|проректор]] колеџа.<ref name=EB1911/>
