InterPro — разлика између измена
Садржај обрисан Садржај додат
мНема описа измене |
мНема описа измене |
||
Ред 2:
-{'''InterPro'''}- je baza podataka [[proteinska familija|proteinskih familija]], domena i funkcionalnih mesta na kojima su nađene prepoznatljive osobine poznatih [[protein]]a koje se mogu primeniti na nove proteinske sekvence<ref name="pmid18940856">{{cite journal | author = Hunter S, Apweiler R, Attwood TK, Bairoch A, Bateman A, Binns D, Bork P, Das U, Daugherty L, Duquenne L, Finn RD, Gough J, Haft D, Hulo N, Kahn D, Kelly E, Laugraud A, Letunic I, Lonsdale D, Lopez R, Madera M, Maslen J, McAnulla C, McDowall J, Mistry J, Mitchell A, Mulder N, Natale D, Orengo C, Quinn AF, Selengut JD, Sigrist CJ, Thimma M, Thomas PD, Valentin F, Wilson D, Wu CH, Yeats C | title = InterPro: the integrative protein signature database | journal = Nucleic Acids Research | volume = 37 | issue = Database issue | pages = D211–5 | year = 2009 | month = January | pmid = 18940856 | pmc = 2686546 | doi = 10.1093/nar/gkn785 | url = http://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=18940856 | issn = }}</ref> da bi se funkcionalno karakterisale.
-{InterPro}- sadržaj je baziran na diagnostičkim potpisima i proteinima koji im u značajnoj meri odgovaraju. Potpisi se sastoje of modela (jednostavnih vrsta, poput [[regularni izraz|regularnih izraza]] ili kompleksnijih, kao što su [[Skriveni Markovljevi model]]i) koji opisuju proteinske familije, domene ili mesta. Modeli su izvedeni iz [[aminokiselina|aminokiselinskih]] sekvenci poznatih familija ili domena. Oni su naknadno korišćeni za pretragu nepoznatih sekvenci (kao što su one dobijene sekvenciranjem genoma) sa ciljem njihove klasifikacije. Svaki član kolekcije -{InterPro}- baza podataka doprinosi različitoj niši, od veoma visokog nivoa, strukturno-bazirane klasifikacije (-{[[SUPERFAMILY]]}- i -{CATH-Gene3D}-) do veoma specifičnih klasifikacija pod-familija (-{[[PRINTS]]}- i -{PANTHER}-).
== Literatura ==
| |||