Википедија

RNK splajsovanje — разлика између измена

Интерактиван преглед историје
← Старија изменаНовија измена →
Садржај обрисан Садржај додат
ВизуелноВикитекст
м Бот: Селим 28 међујезичких веза, које су сад на Википодацима на d:q237218
Autobot (разговор | доприноси)
1.572.075 измена
м ispravke; козметичке измене
Ред 1:
[[ImageДатотека:Pre-mRNA to mRNA.svg|right|thumbnail|350px|right|Jednostavna ilustracija eksona i introna u pre-iRNK i formacija maturisane iRNK splajsovanjem. UTR segment su nekodirajući delovi eksona na krajevima iRNK.]]
U [[molekularna biologija|molekularnoj biologiji]] i [[genetika|genetici]], '''splajsovanje''' je modifikacija [[RNK]] nakon [[transkripcija (genetika)|transkripcije]], u kojoj se [[intron]]i uklanjaju, a [[ekson]]i se spajaju. Ono je neophodno da bi tipična [[eukariote|eukariotska]] [[iRNK|informaciona RNK]] mogla da se koristi za proizvođenje korektnog proteina putem [[translacija (genetika)|translacije]]. Za mnoge eukariotske introne, splajsovanje se vrši putem serije reakcija koje su [[Катализатор|katalizovane]] [[splajsozom]]om, kompleksom malih nukleusnih ribonukleoproteina ([[snRNP]]). Takođe postoje i samostalno splajsujući introni.
 
Ред 5:
U prirodi se splajsovanje odvija na nekoliko načina. Tip splajsovanja zavisi od strukture introna i neophodnog [[katalizator]]a.
 
=== Splajsozomalni introni ===
Splajsozomalni introni se često nalaze unutar sekvence [[eukariote|eukariotskih]] gena koji kodiraju proteine. Intron sadrži 3' splajsno mesto, 5' splajsno mesto i mesto grananja. 5' splajsno mesto ili mesto splajsnog donora sadrži skoro nepromenljivu sekvencu -{GU}- na 5' kraju introna, unutar većeg manje konzerviranog konsenzusnog regiona. 3' splajsno mesto ili mesto splajsnog akceptora završava intron sa skoro nepromenljivom -{AG}- sekvencom. Ispred AG (u 5' smeru) postoji region sa visokim sadržajem [[pirimidin]]a (C i U), ili [[polipirimidinski trakt]]. Ispred njega je tačka grananja, koja sadrži adeninske nukleotide.<ref>{{cite journal |author = Clancy Suzanne |title=RNA Splicing: Introns, Exons and Spliceosome |journal=Nature Education |year=2008 |volume=1 |issue=1 |url=http://www.nature.com/scitable/topicpage/rna-splicing-introns-exons-and-spliceosome-12375 |accessdate = 31. March3. 2011. }}</ref><ref name=Black>{{cite journal | author = Black Douglas L. | title = Mechanisms of alternative pre-messenger RNA splicing | journal = Annual Reviews of Biochemistry | volume = 72 | issue = 1 | pages = 291–336 | year = 2003 | doi = 10.1146/annurev.biochem.72.121801.161720 | pmid = 12626338}}</ref> Tačkaste mutacije u DNK ili greške tokom transkripcije mogu da aktiviraju „kriptično splajsno mesto“ u delu transkripta koji obično nije splajsovan. To dovodi do formiranja [[maturisana informaciona RNK|maturisane iRNK]] sa nedostajućom sekcijom eksona. Na taj način se [[Генске мутације|tačkasta mutacija]], koja obično utiče samo na jednu aminokiselinu, može manifestovati kao [[delecija]] u finalnom proteinu.
[[ImageДатотека:Intron miguelferig.jpg|450px|center]]
 
=== Formiranje i dejstvo splajsozoma ===
Splajsovanje katališe [[splajsozom]], veliki RNK-proteinski kompleks koji se sastoji od pet malih nukleusnih ribonukleoproteina (-{[[snRNP]]}-). RNK komponente -{snRNP}- proteina formiraju interakcije sa intronom i mogu da učestvuju u katalizi. Dva tipa splajsozoma su poznata (glavni i sporedni). Oni sadrže različite -{snRNP}- proteine.
* Glavni
:Glavni splajsozom izdvaja introne koji sadrže -{GU}- na 5' splajsnom mestu i -{AG}- na 3' splajsnom mestu. On se sastoji od [[U1 |U1]], [[U2 spliceosomal RNA|U2]], [[U4 splajsozomalna RNK|U4]], [[U5 splajsozomalna RNK|U5]] i [[U6 splajsozomalna RNK|U6]] snRNP-a, i aktivan je u nukleusu. Pored njih brojni drugi protein, među kojima su [[U2AF2|-{U2AF}-]] i [[SF1 (gen)|-{SF1}-]], su neophodni za formiranje splajsozoma.<ref name="Black"/><ref name=Matlin>{{cite journal | author = Matlin AJ, Clark F, Smith, CWJ | title = Understanding alternative splicing: towards a cellular code | journal = Nature Reviews | volume = 6 | pages = 386–398 | date = May 2005 | pmid = 15956978 | issue = 5 | doi = 10.1038/nrm1645}}</ref>
 
<!--:* E kompleks-U1 se vezuje za -{GU}- sekvencu na 5' splajsnom mestu, zajedno sa pomoćnim proteinima/enzimima -{ASF/SF2, U2AF}- (vezuje se na -{Py-AG}- mesto), SF1/BBP
Ред 20:
:*C1 kompleks-U4 se otpušta, U6/U2 katališe transesterifikaciju, dolazi do ligacije 5' kraja introna sa A on intron and form a lariat ,U5 binds exon at 3' splice site, and the 5' site is cleaved, resulting in the formation of the lariat;
:*C2 kompleks-U2/U5/U6 remain bound to the lariat, and the 3' site is cleaved and exons are ligated using ATP hydrolysis. The spliced RNA is released and the lariat debranches.-->
:Ovaj tip splajsovanja se naziva ''kanoničko splajsovanje''. Ono je zastupljeno u više od 99% slučajeva.<ref>{{cite journal |author=Ng B, Yang F, Huston DP, ''et al.'' |title=Increased noncanonical splicing of autoantigen transcripts provides the structural basis for expression of untolerized epitopes |journal=J. Allergy Clin. Immunol. |volume=114 |issue=6 |pages=1463–70 |year=2004 |month=December |pmid=15577853 |doi=10.1016/j.jaci.2004.09.006}}</ref>
 
* Pomoćni
:[[Pomoćni splajsozom]] je veoma sličan glavnom. On deluje na retkim intronima sa različitim splajsnim mestima. Dok oba splajsoma sadrže isti U5 -{snRNP}-, pomoćni ima različite ali funkcionalno analogne -{snRNP}- proteine, koji se nazivaju [[U11 splajsozomalna RNK|U11]], [[U12 pomoćna splajsozomalna RNK|U12]], -{U4atac}-, i -{U6atac}-.<ref>{{cite journal |author=Patel AA, Steitz JA |title=Splicing double: insights from the second spliceosome |journal=Nat. Rev. Mol. Cell Biol. |volume=4 |issue=12 |pages=960–70 |year=2003 |pmid=14685174 |doi=10.1038/nrm1259}}</ref> Poput glavnog splajsozoma, on se jedino nalazi u jedru.<ref>{{cite journal |author=Friend K, Kolev NG, Shu MD, Steitz JA |title=Minor-class splicing occurs in the nucleus of the Xenopus oocyte |journal=RNA |volume=14 |issue=8 |pages=1459–62 |year=2008 |pmid=18567814 |url=http://rnajournal.cshlp.org/content/14/8/1459.full |doi=10.1261/rna.1119708 |pmc=2491479}}</ref>
* Trans-splajsovanje
:[[Trans-splajsovanje]] je forma splajsovanje koja spaja dva eksona koji nisu unutar istog RNK transkripta.<ref>{{cite journal |author=Di Segni G, Gastaldi S, Tocchini-Valentini GP |title=Cis- and trans-splicing of mRNAs mediated by tRNA sequences in eukaryotic cells |journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |volume=105 |issue=19 |pages=6864–9 |year=2008 |month=May |pmid=18458335 |pmc=2383978 |doi=10.1073/pnas.0800420105}}</ref>
 
=== Samostalno splajsovanje ===
Samostalno splajsovanje se javlja kod retkih introna koji formiraju [[ribozim]], tako da funkcije splajsozoma obavlja sama RNK. Postoje tri vrste samostalno splajsujućih introna, ''[[Grupa I katalitičkog introna|Grupa I]]'', ''[[Grupa II introna|Grupa II]]'' i ''[[Grupa III introna|Grupa III]]''. Grupe I i II introna izvode splajsovanje na sličan način sa splajsozomom. Ova sličnost sugeriše da su introni grupe I i II možda evoluciono srodni sa splajsozomom.
 
Ред 33:
{{reflist|2}}
 
== Vidi još ==
{{Columns-list|2|
*[[cDNK]]
Ред 41:
*[[Splajsozom]]
}}
== Spoljašnje veze ==
{{Commons category|Splicing}}
* [http://vcell.ndsu.nodak.edu/animations/mrnasplicing/index.htm iRNK splajsovanje]
* {{MeshName|RNA+Splicing}}
 
[[Категорија:РНК сплајсовање]]
Преузето из „https://sr.wikipedia.org/wiki/RNK_splajsovanje”