Циркуларни дихроизам — разлика између измена
Садржај обрисан Садржај додат
м ref=harv |
м ispravke |
||
Ред 75:
Ултраљубичасти ЦД спектар протеина може предвидети важне карактеристике њихове [[секундарна структура proteina|секундарне структуре]]. Предикција секундарне структуре заснива се на претпоставци да је ЦД спектар протеина, због изразите оптичке активности пептидне [[хромофор]]е, одраз његове секундарне структуре. За пептидну хромофору карактеристични су -{n -> π*}- прелаз на 220-{nm}- и π -> π* прелаз на 190 -{nm}-. Процену структуре протеина се врши помоћу ЦД спектара синтетичких полимера који имају структуру 100 % [[Алфа хеликс|α-хеликса]], 100% [[Бета раван|β-равни]], 100% насумичног клупка (случајна структура) итд. Ова фракционална именовања важна су јер упућују на могуће секундарне конформације у којима може бити протеин. На пример, поли-Л-лизин -{{(Lys)n}}- може усвојити 3 различите конформације само за различите вредности -{[[pH вредност|pH]]}- и температуре: насумично клупко на -{pH}- 7,0 ; [[Алфа хеликс|α-хеликс]] на -{pH}- 10,8 ; [[Бета раван|β-облик]] на -{pH}- 11,1 после загревања до 52-{°C}- и хлађења.
[[Датотека:CD spektri.JPG|200п|лево|мини|ЦД спектри синтетичких полимера који имају структуру 100% [[Алфа хеликс|α-хеликса]], 100% [[Бета раван|β-равни]] и 100% насумично клупко.<ref>
ЦД спектар непознатог протеина = -{f<sub>α</sub>S<sub>α</sub>(λ) + f<sub>β</sub>S<sub>β</sub>(λ) + f<sub>RC</sub>S<sub>RC</sub>(λ)}-, где су -{S<sub>α</sub>(λ), S<sub>β</sub>(λ)}-, и -{S<sub>RC</sub>(λ)}- изведене из основног спектра поли-Л-лизина. Недостатак ове методе је то што иако је лако добити вредности за -{S<sub>α</sub>(λ), S<sub>β</sub>(λ)}-, и -{S<sub>RC</sub>(λ)}- из директних мерења, оне нису увек усаглашене од једне лабораторије до друге. Такође, мора се узети у обзир и дужина ланца и утицај [[агрегатно стање|агрегатног стања]] овог скупа база спектра. Међутим, овај метод је обично тачан до 10% за садржај [[Алфа хеликс|α-хеликса]].
| |||