Накајама је рођен у Јамагучи префектури. Каратеом је почео да се бави након уписа на [[Такушоку универзитет]] [[1932]]. године, где је тренирао код [[Фунакоши Гичин]]а и Фунакошијевог сина [[Фунакоши Гиго|Јошитаке]]. Накајама је студирао кинески језик и отишао је у [[Кина|Кину]] као преводилац и део тима за салушавање при јапанским инвазионим снагама [[1937]]. године. У Јапан се вратио [[1946]]. године.
Године 1949. основао је [[Јапанска Карате Асоцијација|Јапанску Карате Асоцијацију]] са [[Фунакоши Гичин]]омГичином као главним инструктором, и почео реструктуише тренинге следећи методе развијене у модерној спортској науци. Увео је [[карате ката|кату]] и [[кумите]] као турнирске дисциплине. Ученици великог [[Јапанска Карате Асоцијација|ЈКА]] [[доџо]]а су потом остварили незабележене турнирске успехе у педесетим и шездесетим годинама прошлог века. Накајама је такође познат по раду на ширењу [[шотокан]] [[карате]]а по читавом свету. Заједно са учитељем Фунакошијем основао је ЈКА инструкторски тренинг програм. Високо обучени дипломци овог програма основали су [[шотокан]] доџое у преко сто различитих земаља на свету. Нажалост, након Накајамине смрти ЈКА се поделио, и многи познати инструктори су основали сопствене асоцијације: Јапанска Шотокан карате Асоцијација (Кеиго Абе), Јапански Карате Шотокаи (Тецухико Асаи), Каратеномичи (Микио Јахара).
