Рита Касадио (енгл. Rita Casadio) је ванредна професорка Одељења за фармацију и биотехнологију Универзитета у Болоњи.[1][2]

Рита Касадио
Место рођењаИталија
Веб-сајтwww.biocomp.unibo.it/casadio/

Биографија уреди

Дипломирала је на Универзитету у Болоњи након чега је похађала неколико курсева у Италији и иностранству и стекла искуство из различитих области као што су рачунарство, биофизика мембрана и протеина, биоенергетика и термодинамика.[3] Након рада у лабораторијама за биофизику у Сједињеним Америчким Државама и у Немачкој 1987. године је постала доцент биофизике на Универзитету у Болоњи.[3] Од 1. октобра 2001. је редовни професор биохемије, углавном се бави областима биофизике мембрана и протеина.[3] Од 2011. године је професор на Универзитету у Шангају.[3] Тренутно ради на компјутерском моделирању релевантних биолошких процеса као што су преклапање протеина и моделирање њихове стабилности и интеракција. Једно од главних поља њених истраживања је примена метода машинског учења за предвиђање секундарне и терцијарне структуре протеина из њихових секвенци аминокиселинских остатака, посебно мембранских протеина и њихове трансмембранске топологије. Ради као руководилац Центра за биотехнолошка истраживања Универзитета у Болоњи и њена истраживања су посвећена различитим аспектима моделирања протеина, укључујући предвиђање секундарних и терцијарних структура са неуронским мрежама, генетски алгоритми, молекуларно спајање, механизми протеинске реакције и нови дизајн спиралних пептида.[3] Ауторка је око триста научних радова и презентовала је свој рад на више од триста домаћих и међународних скупова.[3] Њен рад у машинском учењу је коришћен за предвиђање структуре протеина, а методе из њене групе су високо рангиране на међународним такмичењима као што су Критичка процена предвиђања структуре протеина (CASP) и Критичка процена анотације функције (CAFA).[4][5][6][7] Организовала је међународне школе биоинформатике, била је копредседавајући WABI 2005, у уређивачком је одбору BMC биоинформатике и рударења биоподатака, била је председница Болоњског међународног мастера за биоинформатику 2007—20015, била је члан управног одбора I.N.B.B, италијанског међууниверзитетског конзорцијума у својству представника италијанског министра MIUR-а, Међународног друштва за рачунарску биологију и Италијанског друштва за биоинформатику.[3] Дописни је члан Академије науке Института у Болоњи.[3] Изабрана је за члана Међународног друштва за рачунарску биологију (ISCB) 2020. године за изузетан допринос у областима рачунарске биологије и биоинформатике.[8]

Референце уреди

  1. ^ Griffin, Martin; Casadio, Rita; Bergamini, Carlo M. (2002). „Transglutaminases: Nature's biological glues”. Biochemical Journal. 368 (2): 377—396. ISSN 0264-6021. PMC 1223021 . PMID 12366374. doi:10.1042/bj20021234. 
  2. ^ Capriotti, E.; Fariselli, P.; Casadio, R. (2005). „I-Mutant2.0: predicting stability changes upon mutation from the protein sequence or structure”. Nucleic Acids Research. 33 (Web Server): W306—W310. ISSN 0305-1048. PMC 1160136 . PMID 15980478. doi:10.1093/nar/gki375. 
  3. ^ а б в г д ђ е ж „Rita Casadio — University of Bologna — Home Page”. www.unibo.it. Приступљено 2023-03-07. 
  4. ^ Anon (2020). „ISCB Fellows”. iscb.org. International Society for Computational Biology. Архивирано из оригинала 20. 03. 2017. г. Приступљено 07. 03. 2023. 
  5. ^ Radivojac, Predrag; Clark, Wyatt T; Oron, Tal Ronnen; Schnoes, Alexandra M; Wittkop, Tobias; Sokolov, Artem; Graim, Kiley; et al. (2013). „A large-scale evaluation of computational protein function prediction”. Nature Methods. 10 (3): 221—227. ISSN 1548-7091. PMC 3584181 . PMID 23353650. doi:10.1038/nmeth.2340. 
  6. ^ Rost, Burkhard; Sander, Chris; Casadio, Rita; Fariselli, Piero (2008). „Transmembrane helices predicted at 95% accuracy”. Protein Science. 4 (3): 521—533. ISSN 0961-8368. PMC 2143072 . PMID 7795533. doi:10.1002/pro.5560040318. 
  7. ^ Rost, Burkhard; Fariselli, Piero; Casadio, Rita (1996). „Topology prediction for helical transmembrane proteins at 86% accuracy-Topology prediction at 86% accuracy”. Protein Science. 5 (8): 1704—1718. ISSN 0961-8368. PMC 2143485 . PMID 8844859. doi:10.1002/pro.5560050824. 
  8. ^ Anon (2020). „ISCB Congratulates and Introduces the 2020 Class of Fellows!”. iscb.org. International Society for Computational Biology.