Интернационални хемијски идентификатор
Интернационални хемијски идентификатор (InChI) је текстуални идентификатор хемијских супстанци. Он је дизајниран да буде стандард кодирања молекулске информације који је једноставан за читање, и истовремено прикладан за претрагу информација у базама података. Развиле су га је организације ИУПАЦ (енгл. International Union of Pure and Applied Chemistry) и НИСТ (енгл. National Institute of Standards and Technology) у току 2000-2005. Формат и алгоритми су незаштићени, и имплементирани су у рачунарским програмима који су слободно доступни под ЛГПЛ лиценцом отвореног кода. Термин InChI је трговинска ознака ИУПАЦ организације.[1]
Преглед уреди
Ови идентификатори описују хемијске супстанце у виду информационих слојева — атоми и хемијске везе, таутомерска информација, изотопска информација, стерео-хемија, јонизација. Сви слојеви нису увек неопходни, на пример, таутомерски слој се може изоставити кад та је врста информације неважна.
InChI идентификатори се разликује од ЦАС бројева у три погледа:
- они су незаштићени,
- они се могу формирати на бази хемијске структуре,
- највећи део InChI идентификатора се може читати (уз мало праксе).
ИнЦхИ идентификатори се могу сматрати генералном I веома формалном верзијом ИУПАЦ имена. Они могу садржати већи информациони садржај него једноставнија СМИЛЕС нотација. Попут каноничких СМИЛЕС они су јединствени низови знакова, и прикладни су за употребу у базама података. 3Д координате атома нису део InChI формата.
ИнЦхИ алгоритам претвара структурну информацију у јединствени InChI идентификатор у три степена: нормализација (одстрањивање непотребних података), канонизација (стварање јединствене нумеричке етикете атома), и формирање низа знакова.
InChIKey је каширани InChI идентификатор са фиксном дужином од 25 знакова. InChIKey спецификација је објављена у Септембру 2007. године да би се омогућила Веб претраживања хемијских једињења, пошто је то било проблематично користећи InChI.[2]
Примери уреди
| CH3CH2OH етанол |
InChI=1/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3 |
 L-аскорбинска киселина |
InChI=1/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-10H,1H2/t2-,5+/m0/s1 |
Види још уреди
Литература уреди
- ^ МцНаугхт, Алан (2006). „Тхе ИУПАЦ Интернатионал Цхемицал Идентифиер:ИнЦхл”. Цхемистрy Интернатионал. 28 (6). ИУПАЦ.
- ^ „Тхе ИУПАЦ Интернатионал Цхемицал Идентифиер (ИнЦхИ)”. ИУПАЦ. 5. 9. 2007. Архивирано из оригинала 30. 10. 2007. г.
Спољашње везе уреди
Документација и презентације уреди
- ИУПАЦ ИнЦхИ локација
- Неслужбена ИнЦхИ ФАQ Архивирано на сајту Wayback Machine (6. март 2012)
- ИнЦхИ техничка упутства
- Опис алгоритма канонизације
- Гооглинг фор ИнЦхИс W3Ц презентација
- ИУПАЦ ИнЦхИ Архивирано на сајту Wayback Machine (25. новембар 2011), Гоогле Тецх Талк бy Стеве Хеллер анд Стеве Стеин, 2 Новембер 2006
Софтвер и услуге уреди
- НЦИ/ЦАДД Цхемицал Идентифиер Ресолвер, Генерише и претвара InChI/InChIKeys и многе друге хемијске идентификаторе
- Генерате ИнЦхИ, Интерактивна служба на Универзитету Кембриџа
- Сеарцх Гоогле фор молецулес, Генерише InChI из интерактивно нацртаних молекула, и претражује Гоогле. Јавасцрипт оспособљен Веб претраживач је потребан
- ЦхемСкетцх Архивирано на сајту Wayback Machine (18. октобар 2006), Бесплатан програм за цртање хемијских структура са улазом и излазом у InCHI формату
- ПубЦхем
- ЦхемСпидер Сервицес
- МарвинСкетцх ЦхемАxон
- БКцхем Архивирано на сајту Wayback Machine (9. јун 2007)