ЛИГ4

Лигаза IV, ДНК, АТП-зависна
Лигаза IV, ДНК, АТП-зависна
	ПДБ приказ базиран на 1ик9.
Доступне структуре
	1ИК9, 2Е2W, 3ИИ6
Идентификатори
Симбол	ЛИГ4
Вањски ИД	ОМИМ: 601837 МГИ: 1335098 ХомолоГене: 1736 ГенеЦардс: ЛИГ4 Гене
ЕЦ број	6.5.1.1
Онтологија гена
Молекуларна функција	• везивање нуклеотида; • ДНК везивање; • активност ДНК лигазе; • активност ДНК лигазе (АТП); • протеинско везивање; • АТП везивање; • везивање протеин C-терминуса; • активност лигазе; • везивање металног јона;
Целуларна компонента	• кондензовани хромозом; • интрацелуларни; • једро; • нуклеоплазма; • нуклеолус; • цитоплазма; • ћелијска мембрана; • фокална адхезија; • ДНК зависна протеинска киназа - ДНК лигаза 4 комплекс; • комплекс ДНК лигазе IV; • комплекс нехомологног спајања крајева;
Биолошки процес	• поправка једноланчаних прекида; • ин утеро ембрионски развој; • про-Б ћелијска диференцијација; • репликација ДНК; • лигација ДНК; • поправка ДНК; • поправка дволанчаних прекида;
Преглед РНК изражавања
	подаци
Ортолози
Врста	Човек
Ентрез	3981
Енсембл	ЕНСГ00000174405
УниПрот	П49917
РефСеq (мРНА)	НМ_001098268.1
РефСеq (протеин)	НП_001091738.1
Локација (УЦСЦ)	Цхр 13:; 108.86 - 108.87 Мб
ПубМед претрага	[1]

LIG4 је ген који кодира протеинску ДНК лигазу IV.^[1] Овај протеин је АТП зависна ДНК лигаза која спаја дволанчане прекиде током нехомологног спајања крајева у путу поправке прекида двоструког ланца. Он је такође есенцијалан за V(D)J рекомбинацију.

Дефекти овог гена узрокују ЛИГ4 синдром. Лиг4 хомолог у квасцу је Dnl4.

Интеракције уреди

Lig4 формира комплекс са XRCC4,^[2]^[3] и даље интерагује са ДНК зависном протеинском киназом (DNA-PK) и XLF/Cernunnos.

Референце уреди

^ „Ентрез Гене: ЛИГ4 лигасе IV, ДНА, АТП-депендент”.
^ Десхпанде Рајасхрее А; Wилсон Тхомас Е (2007). „Модес оф интерацтион амонг yеаст Неј1, Лиф1 анд Днл4 протеинс анд цомпарисон то хуман XЛФ, XРЦЦ4 анд Лиг4”. ДНА Репаир (Амст.). Нетхерландс. 6 (10): 1507—16. ИССН 1568-7864. ПМЦ 2064958  . ПМИД 17567543. дои:10.1016/ј.днареп.2007.04.014.
^ Сибанда БЛ, Цритцхлоw СЕ, Бегун Ј, Пеи XY, Јацксон СП, Блунделл ТЛ, Пеллегрини L (2001). „Црyстал струцтуре оф ан Xрцц4-ДНА лигасе IV цомплеx”. Нат. Струцт. Биол. Унитед Статес. 8 (12): 1015—9. ИССН 1072-8368. ПМИД 11702069. дои:10.1038/нсб725.

Литература уреди

Wеи YФ; Робинс П; Цартер К; et al. (1995). „Молецулар цлонинг анд еxпрессион оф хуман цДНАс енцодинг а новел ДНА лигасе IV анд ДНА лигасе III, ан ензyме ацтиве ин ДНА репаир анд рецомбинатион”. Мол. Целл. Биол. 15 (6): 3206—16. ПМЦ 230553  . ПМИД 7760816.
Робинс П, Линдахл Т (1996). „ДНА лигасе IV фром ХеЛа целл нуцлеи”. Ј. Биол. Цхем. 271 (39): 24257—61. ПМИД 8798671. дои:10.1074/јбц.271.39.24257.
Граwундер У; Wилм M; Wу X; et al. (1997). „Ацтивитy оф ДНА лигасе IV стимулатед бy цомплеx форматион wитх XРЦЦ4 протеин ин маммалиан целлс”. Натуре. 388 (6641): 492—5. ПМИД 9242410. дои:10.1038/41358.
Цритцхлоw СЕ, Боwатер РП, Јацксон СП (1997). „Маммалиан ДНА доубле-странд бреак репаир протеин XРЦЦ4 интерацтс wитх ДНА лигасе ИВ”. Цурр. Биол. 7 (8): 588—98. ПМИД 9259561. дои:10.1016/С0960-9822(06)00258-2.
Граwундер У, Зиммер D, Леибер МР (1998). „ДНА лигасе IV биндс то XРЦЦ4 виа а мотиф лоцатед бетwеен ратхер тхан wитхин итс БРЦТ домаинс”. Цурр. Биол. 8 (15): 873—6. ПМИД 9705934. дои:10.1016/С0960-9822(07)00349-1.
Граwундер У; Зиммер D; Фугманн С; et al. (1998). „ДНА лигасе IV ис ессентиал фор V(D)Ј рецомбинатион анд ДНА доубле-странд бреак репаир ин хуман прецурсор лyмпхоцyтес”. Мол. Целл. 2 (4): 477—84. ПМИД 9809069. дои:10.1016/С1097-2765(00)80147-1.
Рибалло Е; Цритцхлоw СЕ; Тео СХ; et al. (1999). „Идентифицатион оф а дефецт ин ДНА лигасе IV ин а радиосенситиве леукаемиа патиент”. Цурр. Биол. 9 (13): 699—702. ПМИД 10395545. дои:10.1016/С0960-9822(99)80311-X.
Ким СТ, Лим ДС, Цанман ЦЕ, Кастан МБ (2000). „Субстрате специфицитиес анд идентифицатион оф путативе субстратес оф АТМ кинасе фамилy мемберс”. Ј. Биол. Цхем. 274 (53): 37538—43. ПМИД 10608806. дои:10.1074/јбц.274.53.37538.
Ницк МцЕлхиннy СА, Сноwден CM, МцЦарвилле Ј, Рамсден ДА (2000). „Ку Рецруитс тхе XРЦЦ4-Лигасе IV Цомплеx то ДНА Ендс”. Мол. Целл. Биол. 20 (9): 2996—3003. ПМЦ 85565  . ПМИД 10757784. дои:10.1128/МЦБ.20.9.2996-3003.2000.
Цхен L, Трујилло К, Сунг П, Томкинсон АЕ (2000). „Интерацтионс оф тхе ДНА лигасе IV-XРЦЦ4 цомплеx wитх ДНА ендс анд тхе ДНА-депендент протеин кинасе”. Ј. Биол. Цхем. 275 (34): 26196—205. ПМИД 10854421. дои:10.1074/јбц.М000491200.
Лее КЈ, Хуанг Ј, Такеда Y, Дyнан WС (2000). „ДНА лигасе IV анд XРЦЦ4 форм а стабле миxед тетрамер тхат фунцтионс сyнергистицаллy wитх отхер репаир фацторс ин а целл-фрее енд-јоининг сyстем”. Ј. Биол. Цхем. 275 (44): 34787—96. ПМИД 10945980. дои:10.1074/јбц.М004011200.
Рибалло Е; Дохертy АЈ; Даи Y; et al. (2001). „Целлулар анд биоцхемицал импацт оф а мутатион ин ДНА лигасе IV цонферринг цлиницал радиосенситивитy”. Ј. Биол. Цхем. 276 (33): 31124—32. ПМИД 11349135. дои:10.1074/јбц.М103866200.
Сибанда БЛ; Цритцхлоw СЕ; Бегун Ј; et al. (2002). „Црyстал струцтуре оф ан Xрцц4-ДНА лигасе IV цомплеx”. Нат. Струцт. Биол. 8 (12): 1015—9. ПМИД 11702069. дои:10.1038/нсб725.
О'Дрисцолл M; Церосалетти КМ; Гирард ПМ; et al. (2002). „ДНА лигасе IV мутатионс идентифиед ин патиентс еxхибитинг девелопментал делаy анд иммунодефициенцy”. Мол. Целл. 8 (6): 1175—85. ПМИД 11779494. дои:10.1016/С1097-2765(01)00408-7.
Кусцхел Б; Ауранен А; МцБриде С; et al. (2002). „Вариантс ин ДНА доубле-странд бреак репаир генес анд бреаст цанцер сусцептибилитy”. Хум. Мол. Генет. 11 (12): 1399—407. ПМИД 12023982. дои:10.1093/хмг/11.12.1399.
Махајан КН, Ницк МцЕлхиннy СА, Митцхелл БС, Рамсден ДА (2002). „Ассоциатион оф ДНА Полyмерасе μ (пол μ) wитх Ку анд Лигасе IV: Роле фор пол μ ин Енд-Јоининг Доубле-Странд Бреак Репаир”. Мол. Целл. Биол. 22 (14): 5194—202. ПМЦ 139779  . ПМИД 12077346. дои:10.1128/МЦБ.22.14.5194-5202.2002.
Ротх ДБ (2002). „Амплифyинг мецханисмс оф лyмпхомагенесис”. Мол. Целл. 10 (1): 1—2. ПМИД 12150897. дои:10.1016/С1097-2765(02)00573-7.
Смогорзеwска А; Карлседер Ј; Холтгреве-Грез Х; et al. (2003). „ДНА лигасе IV-депендент НХЕЈ оф депротецтед маммалиан теломерес ин Г1 анд Г2”. Цурр. Биол. 12 (19): 1635—44. ПМИД 12361565. дои:10.1016/С0960-9822(02)01179-X.
Роддам ПЛ; Роллинсон С; О'Дрисцолл M; et al. (2003). „Генетиц вариантс оф НХЕЈ ДНА лигасе IV цан аффецт тхе риск оф девелопинг мултипле мyелома, а тумоур цхарацтерисед бy аберрант цласс сwитцх рецомбинатион”. Ј. Мед. Генет. 39 (12): 900—5. ПМЦ 1757220  . ПМИД 12471202. дои:10.1136/јмг.39.12.900.
Страусберг РЛ; Феинголд ЕА; Гроусе ЛХ; et al. (2003). „Генератион анд инитиал аналyсис оф море тхан 15,000 фулл-ленгтх хуман анд моусе цДНА сеqуенцес”. Проц. Натл. Ацад. Сци. У.С.А. 99 (26): 16899—903. ПМЦ 139241  . ПМИД 12477932. дои:10.1073/пнас.242603899.
Ницхолас C. Прице; Леwис Стевенс (1999). Фундаменталс оф Ензyмологy: Тхе Целл анд Молецулар Биологy оф Цаталyтиц Протеинс (Тхирд изд.). УСА: Оxфорд Университy Пресс. ИСБН 019850229X.
Ериц Ј. Тооне (2006). Адванцес ин Ензyмологy анд Релатед Ареас оф Молецулар Биологy, Протеин Еволутион (Волуме 75 изд.). Wилеy-Интерсциенце. ИСБН 0471205036.
Бранден C; Тоозе Ј. Интродуцтион то Протеин Струцтуре. Неw Yорк, НY: Гарланд Публисхинг. ИСБН 0-8153-2305-0.
Ирwин Х. Сегел. Ензyме Кинетицс: Бехавиор анд Аналyсис оф Рапид Еqуилибриум анд Стеадy-Стате Ензyме Сyстемс (Боок 44 изд.). Wилеy Цлассицс Либрарy. ИСБН 0471303097.

Види још уреди

ДНК лигаза

Спољашње везе уреди

[entrez-1] „Ентрез Гене: ЛИГ4 лигасе IV, ДНА, АТП-депендент”.

[pmid17567543-2] Десхпанде Рајасхрее А; Wилсон Тхомас Е (2007). „Модес оф интерацтион амонг yеаст Неј1, Лиф1 анд Днл4 протеинс анд цомпарисон то хуман XЛФ, XРЦЦ4 анд Лиг4”. ДНА Репаир (Амст.). Нетхерландс. 6 (10): 1507—16. ИССН 1568-7864. ПМЦ 2064958  . ПМИД 17567543. дои:10.1016/ј.днареп.2007.04.014.

[pmid11702069-3] Сибанда БЛ, Цритцхлоw СЕ, Бегун Ј, Пеи XY, Јацксон СП, Блунделл ТЛ, Пеллегрини L (2001). „Црyстал струцтуре оф ан Xрцц4-ДНА лигасе IV цомплеx”. Нат. Струцт. Биол. Унитед Статес. 8 (12): 1015—9. ИССН 1072-8368. ПМИД 11702069. дои:10.1038/нсб725.

[1]

[2]

[3]