Ponovljeni nizovi genoma
Ponovljeni nizovi (repetitivne sekvence) predstavljaju delove DNK u genomu eukariota koji se više puta ponavljaju, odnosno ima ih u više kopija. Pored njih genom eukariota sadrži i jedinstvene nizove nukleotida (jedinstvena DNK )koji se nalaze samo u jednoj kopiji na kojima se vrši transkripcija i-RNK.
Kod čoveka ovi nizovi sačinjavaju oko 50% genoma. Vrlo često se nazivaju genetičkim otpadom (engl. junk DNA) pošto ne sadrže uputstvo za sintezu proteina. Naziv je poprilično neopravdan jer oni sadrže dragocene podatke o:
- evoluciji humanog genoma;
- populacionoj genetici;
- građi hromozoma.
Vrste ponovljenih nizova uredi
Ponovljeni nizovi se mogu podeliti na:
- visokoponovljive nizove i
- umereno ponovljivi nizovi.
Visokoponovljivi nizovi (satelitske DNK) uredi
Satelitske DNK se javljaju u vrelo velikom broju kopija u genomu, više od 105. Obuhvataju ponavljanje istih ili različitih nizova nukleotida dužine od 5-300 nukleotida. U humanom genomu se nalaze u regionu centromera hromozoma. Za satelitske DNK se smatra da se ne transkribuju.
Uloge satelitskih DNK još uvek nisu dovoljno poznate mada se prema nekim podacima smatra da :
- omogućavaju sparivanje homologih hromozoma u profazi mejoze I
- održavaju strukturu hromozoma;
- učestvuju u nastanku novih bioloških vrsta (mišljenja naučnika u vezi ove uloge su podeljena).
Vrlo slični satelitskoj DNK jesu i tzv. tandemski ponovci promenljivog broja ili VNTR geni (od engl. variable number of tandem repeat) koji predstavljaju osnovu testiranja poznatog kao genetički otisci prstiju.
Umereno ponovljivi nizovi (intermedijarni nizovi) uredi
Intermedijarni nizovi nukelotida DNK se javljaju u 10 - 105 kopija u genomu. Za razliku od satelitskih DNK koje se ne transkribuju, ovi nizovi se mogu transkribovati u r-RNK, t-RNK i i-RNK za histone.
U ove nizove nukleotida ubrajaju se:
- familije gena (multigenske familije) koje se sastoje od dva ili više gena koji su nastali duplikacijom predačkog gena; dobro proučene familije gena koje broje manje članova su familije α i β hemoglobina; u genskim familijama se pored aktivnih mogu naći i neaktivni geni nazvani pseudogeni;
- tandemski ponovljeni geni grupisani su u skupove koji se uzastopno ponavljaju; primer su geni za histone koji se u genomu sisara nalaze u 10 - 20 kopija za svaki od pet postojećih histona; u svakom skupu se nalazi po jedan gen za svaki od histona: H1, H2A, H2B, H3 i H4;
- mobilni genetički elementi koji menjaju svoje mesto u genomu pa se nazivaju skoči-geni