638. године Антиохију су освојили [[Арапи]]. Уведени су намети у виду харача и ђизије, забрањена је мисионарска активност. Многе цркве су конфисковане и претворене у [[Џамија|џамије]]. Број хришћана у Сирији под арапским ропством се драстично смањивао све до краја [[11. век|XI века]].
750. године династију Омаида смењује династија [[Абасиди|Абасида]]. Калифат Абасида 30-их година [[10. век|X века]] почиње да се распада и дели на мање независне државе-емирате. Византија, након тога, осваја острво Кипар и Крит, Киликију и Северну Сирију. 969. године византијска војска осваја и град АнтиоохијуАнтиохију. Границе калифата и Византијског царства померају се на територију Сирије, тако да се на овом подручју мешају византијски и арапски утицаји у култури.
У време цара [[Нићифор II Фока|НикифораНићифора II Фоке]] 1078. град освајају [[Јермени]], а 1084. године поново [[Селџуци|Турци Селџуци]], који су га држали 14 година до доласка крсташке војске. [[Крсташки ратови|Крсташи]] [[1098]]. године на територији Сирије оснивају Едеску[[грофовија Едеса|грофовију Едесу]]. Исте године крсташи [[Опсада Антиохије|освајају АнтиохијуАнтиохиј]]у, која долази под власт једног од вођа [[Први крсташки рат|Првог крсташког рата]] [[Боемунд Тарентски|Боемонда тарентскогТарентског]].<ref>[http{{cite book|last=Christensen-Ernst|first=Jørgen|title=Antioch on the Orontes: A History and a Guide|url=https://eparhijaniskabooks.rsgoogle.com/богословље/историја-цркве/868-антиохијска-патријаршија]books?id=y_J1CgAAQBAJ&pg=PA104|date=8 ЕпархијаNovember Нишка,2012|publisher=Hamilton Оснивање града АнтиохијаBooks|isbn=978-0-7618-5864-5|pages=104–}}</ref>
Под крсташком влашћу град остаје скоро 200 година, све до [[1268]]. године, када га освајаја Мамелучки султан Египта Бејбарс[[Бајбарс]].<ref>[http{{cite book|last=Runciman|first=Steven|title=A History of the Crusades|url=https://penelopebooks.uchicagogoogle.educom/Thayer/E/Gazetteer/Places/Asia/Armenia/_Texts/KURARM/30*.htmlbooks?id=mrw8AAAAIAAJ&pg=PA324|date=3 VahanDecember M.1987|publisher=CUP Kurkjian, "New Scourge from Egypt", in ''A History of Armenia'']Archive|isbn=978-0-521-34772-3|pages=324–}}</ref> Услед ратних разарања и онеспособљења пристаништа да прими веће бродове, град никада није повратио своју ранију важност.
У [[15. век|XV веку]] Антиохију осваја отоманска војска и она постаје део [[Османско царство|Отоманског царства]].
[[1822]]. и поново [[1872]]. године Антиохију је погодио земљотрес и у великој мери је разорен.
