Биохемија — разлика између измена

Садржај обрисан Садржај додат
Autobot (разговор | доприноси)
м Разне исправке
Autobot (разговор | доприноси)
м Разне исправке
Ред 173:
[[Purpurne bakterije|Пурпурне]] и [[Zelena sumporna bakterija|зелене фотосинтетичке бактерије]] које користе ове процесе насељавају бескисеоничне хабитате попут плитких муљних језера у којима се -{H<sub>2</sub>S}- генерише из трулеће органске материје.
 
[[Хетеротрофи]] (грчки: -{''hetero''}-, другачије) добијају енергију путем оксидације органских једињења и стога су ултиматно зависни од аутотрофа као извора тих супстанци. [[Aerobni organizam|Облигаторни аероби]] (у које се убрајају животиње) морају да користе O<sub>2</sub>,<ref name=Prescott>{{Cite book|vauthors=Prescott LM, Harley JP, Klein DA |title=Microbiology |publisher = Wm. C. Brown Publishers |year=1996 |edition=3rd |isbn=978-0-697-29390-9|pages=130-131}}</ref> док [[Anaerobni organizam|анаероби]] користе оксидујуће агенсе као што су [[сулфат]]и ([[Sulfate-reducing microorganisms|сулфатно редукујуће]] бактерије<ref name=NR>{{harvnb|Muyzer|Stams|Zhu|Jiang|2004|pp=}}</ref><ref name="schulze">{{Cite book|title=Biodiversity and ecosystem function|url=https://books.google.com/books?id=j8OmrBY-6JAC&pg=PA88&lpg=PA88&dq=desulfurication&source=bl&ots=Bs_gVLZkxl&sig=96Dwvm4v-evvt-Aq_pBqrAYQ6Jc&hl=en&ei=_lbTS62JB8KB8gbS0LzkDw&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=3&ved=0CBwQ6AEwAg#v=onepage&q=desulfurication&f=false|year=1993 |first=Ernst-Detlef|last=Schulze |last2=Mooney|first2=Harold A.|publisher=Springer-Verlag|pages=88-90}}</ref>) или [[нитрат]]и ([[denitrifying bacteria|денитрификујуће]] бактерије<ref name="Zumft">Zumft, W. G. (1997). ''Cell biology and molecular basis of denitrification.'' Microbiology and Molecular Biology Reviews, 61(4), 533–616</ref><ref>{{Cite journal|last=Ji|first=Bin |last2=Yang|first2=Kai |last3=Zhu|first3=Lei |last4=Jiang|first4=Yu |last5=Wang|first5=Hongyu |last6=Zhou|first6=Jun |last7=Zhang|first7=Huining|date=August 2015|title=Aerobic denitrification: A review of important advances of the last 30 years |journal=Biotechnology and Bioprocess Engineering|language=en |volume=20|issue=4|pages=643-651 |doi=10.1007/s12257-015-0009-0 |issn=1226-8372}}</ref>). Многи организми могу да парцијално метаболишу разна органска једињења путем интрамолекуларних оксидационо-редукционих процеса познатих као [[Ферментација (биохемија)|ферментација]]. [[Facultative aerobic organism|Факултативни анаероби]] као што је -{''E. coli''}- могу да расту било у присуству или одсуству O<sub>2</sub>.<ref name="Singleton" /><ref name="Sherris">{{Cite book|editor=Ryan KJ | editor2 = Ray CG | title = Sherris Medical Microbiology | edition = 4th | publisher = McGraw Hill |year=2004 |pages=261-271, 273–296|isbn=978-0-8385-8529-0|pages=261-271, 273–296}}</ref> [[Obligate anaerobe|Облигатни анаероби]], за разлику од тога, бивају отровани присуством O<sub>2</sub>.<ref name=Prescott /><ref name=JMA>{{Cite book|vauthors=Brooks GF, Carroll KC, Butel JS, Morse SA |title=Jawetz, Melnick & Adelberg's Medical Microbiology |publisher = McGraw Hill |year=2007 |edition=24th |pages=307-312|isbn=978-0-07-128735-7}}</ref> Сматра се да њихови метаболизми наликују на метаболизме најранијих животних форми (које су се појавиле пре више од 3,8 милијарди година кад у Земљиној атмосфери није било O<sub>2</sub>. У сваком случају, постоји релативно мали број органских једињења која не могу да буду метаболизована путем неког прокариотског организма.
 
==== Еукариоте ====
Ред 206:
[[Митохондрије]] (грчки: -{''mitos''}-, конац + -{''chondros''}-, гранула) су локације ћелијског дисања (аеробног метаболизма) код скоро свих еукариота.<ref name="mitosomes">{{cite journal|vauthors=Henze K, Martin W | title = Evolutionary biology: essence of mitochondria | journal = Nature | volume = 426 | issue = 6963 |pages=127-128 |date=November 2003 | pmid = 14614484 | doi = 10.1038/426127a | bibcode = 2003Natur.426..127H }}</ref> Ове цитоплазмичне органеле, које су довољно велике да су их открили цитолози деветнаестог века, варирају у погледу величине и облика, али су углавном елипсоидне са димензијама од око 1,0 × 2,0 μm, попут бактерија. Еукариотске ћелије типично садрже око 2000 митохондрија, које заузимају око једне петине њихове тоталне запремине.<ref name="pmid26777473">{{cite journal|vauthors=Wiemerslage L, Lee D | title = Quantification of mitochondrial morphology in neurites of dopaminergic neurons using multiple parameters | journal = Journal of Neuroscience Methods | volume = 262 |pages=56-65 |date=March 2016 | pmid = 26777473 | pmc = 4775301 | doi = 10.1016/j.jneumeth.2016.01.008 }}</ref>
 
Митохондрија, као што је првобитно показано електронско микроскопским изучавањима [[George Emil Palade|Ђеорга Палада]]<ref name="The Independent">{{cite news|title=Prof. George Palade: Nobel prize-winner whose work laid the foundations for modern molecular cell biology |publisher=The Independent |date=22. 10. 2008. |url=https://www.independent.co.uk/news/obituaries/prof-george-palade-nobel-prizewinner-whose-work-laid-the-foundations-for-modern-molecular-cell-biology-968560.html |accessdate=09. 02. 2011 |deadurl=yes |archiveurl=https://web.archive.org/web/20101019141647/http://www.independent.co.uk/news/obituaries/prof-george-palade-nobel-prizewinner-whose-work-laid-the-foundations-for-modern-molecular-cell-biology-968560.html |archivedate=19. 10. 2010 }} [http://journalisted.com/article/jx6y Archived]. ([[Internet Archive]] copy)</ref> и [[Fritiof S. Sjöstrand|Фритјофа Сјостранда]],<ref>{{Cite journal|url=https://books.google.com/?id=hHlmAAAAMAAJ&q=%22Sj%C3%B6strand,+Fritiof+Stig%22+AND+%221912%22&dq=%22Sj%C3%B6strand,+Fritiof+Stig%22+AND+%221912%22 | title = Leaders in American science |year=1963}}</ref><ref name="KI Bio">[http://ki.se/ki/jsp/polopoly.jsp?d=22576&l=sv Fritiof S. Sjöstrand - Biografi] {{webarchive |url=https://web.archive.org/web/20110718011200/http://ki.se/ki/jsp/polopoly.jsp?d=22576&l=sv |date=18. 07. 2011 }}, Karolinska Institutet 200 years </ref> има две мембране:<ref name="KI Hur">[http://ki.se/ki/jsp/polopoly.jsp?d=22576&a=55947&l=sv Hur anatomiska institutionen blev internationellt centrum för elektronmikroskopi] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20110718011345/http://ki.se/ki/jsp/polopoly.jsp?d=22576&a=55947&l=sv |date=18. 07. 2011 }}</ref> глатку спољашњу мембрану и веома наборану унутрашњу мембрану чије се инвагнације називају [[Crista|кристама]]<ref name=Griparic2001>{{cite journal|last=Griparic|first=L|last2=van der Bliek|first2=AM|title=The many shapes of mitochondrial membranes.|journal=Traffic (Copenhagen, Denmark)|date=August 2003 |volume=2|issue=4 |pages=235-44|pmid=11285133 |doi=10.1034/j.1600-0854.2001.1r008.x}}</ref><ref>{{cite journal|last=Sjostrand|first=F |title=Systems of double membranes in the cytoplasm of certain tissue cells|journal=Nature|date=03. 01. 1953|volume=171 |pages=31-32|doi=10.1038/171031a0|url=http://www.nature.com/nature/journal/v171/n4340/pdf/171031a0.pdf|accessdate=11. 01. 2015}}</ref> (латински: -{''crests''}-). Митохондрија садржи два преградка, простор унутрашње мембране и простор унутрашњег матрикса. Ензими који катализују реакције дисања су компоненте било желатинозног матрикса или унутрашње митохондријске мембране. Ови ензими спрежу оксидацију нутријената којом се ослобађа енергија са синтезом аденозин трифосфата (АТП) при чему се конзумира енергија. [[Аденозин трифосфат]], након преноса до остатка ћелије, користи се за напајање разних процеса у којима се конзумира енергија.<ref>{{citeCite book|last=Campbell |first=Neil A. |first2 = Brad |last2=Williamson |first3 = Robin J. |last3=Heyden | name-list-format = vanc |title=Biology: Exploring Life |publisher=Pearson Prentice Hall |year=2006 |location=Boston, Massachusetts|url=http://www.phschool.com/el_marketing.html |isbn=978-0-13-250882-7|pages=}}</ref>
 
Митохондрије наликују на бактерије, и то не само у погледу величине. Њихов матрични простор садржи за митохондрије специфичне ДНК, РНК и рибозоме који учествују у синтези неколико митохондријских компоненти. Штавише, оне се репродукују путем бинарне фисије, и респираторни процеси које оне посредују у знатној мери подсећају на оне које се одвијају у модерним аеробним бактеријама. Ова запажања су довела до широко прихваћене хипотезе коју је заговарала [[Лин Маргулис]]<ref>{{cite journal|last=Schaechter |first=M |title=Lynn Margulis (1938–2011) |journal=Science |year=2012 |volume=335 |issue=6066 |pages=302 |doi=10.1126/science.1218027 |pmid=22267805|bibcode=2012Sci...335..302S }}</ref><ref name="Chelsea Green">{{cite book|url=https://books.google.com/books?id=31nEAgAAQBAJ&dq|title=Lynn Margulis: The Life and Legacy of a Scientific Rebel |publisher=Chelsea Green|year=2012|isbn=978-1603584470|editor-last=Sagan|editor-first=Dorion|location=White River Junction}}</ref> да су митохондрије еволуирале из првобитно самосталних грам негативних аеробних бактерија, које су формирале симбиотички однос са примордијалним анаеробним еукариотама. Хранљиве материје које еукариоте прилажу за бактеријску конзумацију се сматра да су вишеструко надокнађене високо ефикасним оксидативним метаболизмом који бактерије пружају еукариотама. Ова хипотеза је подржана запажањем да [[amoeba]] -{''[[Pelomyxa palustris]]''}-, једна од малобројних еукариота без митохондрија, живи у перманентном симбиотичком односу сличне природе са аеробним бактеријама.
Ред 446:
 
== Литература ==
* {{Cite book|ref=harv|last=Campbell |first=Neil A. |first2 = Brad |last2=Williamson |first3 = Robin J. |last3=Heyden | name-list-format = vanc |title=Biology: Exploring Life |publisher=Pearson Prentice Hall |year=2006 |location=Boston, Massachusetts|url=http://www.phschool.com/el_marketing.html |isbn=978-0-13-250882-7|pages=}}
* {{Cite book|ref=harv|url=https://books.google.com/books/about/The_Golgi_Apparatus.html?id=JqIQEFCLVqsC&redir_esc=y|title=The Golgi Apparatus: State of the art 110 years after Camillo Golgi's discovery |vauthors=Pavelk M, Mironov AA|publisher=Springer|year=2008|isbn=978-3-211-76310-0|location=Berlin|pages=580}}
{{refbegin|30em}}
* {{Cite book|ref=harv|url=https://books.google.com/books/about/The_Golgi_Apparatus.html?id=JqIQEFCLVqsC&redir_esc=y|title=The Golgi Apparatus: State of the art 110 years after Camillo Golgi's discovery |vauthors=Pavelk M, Mironov AA|publisher=Springer|year=2008|isbn=978-3-211-76310-0|location=Berlin|pages=580}}
* {{Cite book|ref=harv|chapter=Ch. 1: Section: Electron Microscopy |chapterurl=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9941/#A139 |last=Cooper|first=Geoffrey M.|title=The Cell — A Molecular Approach |publisher=Sinauer Associates |location=Sunderland MA |year=2000 |isbn=978-0-87893-106-4 |edition=2nd |url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9839/ }}
* {{Cite book|ref=harv|last=Marsh|first=Mark| title = Endocytosis| publisher = Oxford University Press|year=2001|pages=vii|isbn=978-0-19-963851-2}}