Beta barel — разлика између измена
Садржај обрисан Садржај додат
м Робот: обликовање ISBN-а |
м ciscenje dupliranih poziva |
||
Ред 2:
[[Датотека:Rbp 1brp.png|thumb|right|250п|[[Čovek|Ljudski]] retinol-vezujući protein (RBP), kanonički [[lipokalin]]ski [[beta lanac|osmolančani]] barel koji vezuje [[retinol]] (vitamin A).]]
'''Beta barel''' je velika [[beta ravan]] koja je uvijena u namotaj tako da je u formiranoj zatvorenoj strukturi prvi prvi lanac [[Vodonična veza|vodonično vezan]] za poslednji. Beta-lanci u beta-barelima su tipično raspoređeni na [[Antiparalelan (biohemija)|antiparalelan]] način. Barelne strukture su često prisutne u [[porin (protein)|porinima]] i drugim proteinima koji premoštavaju [[ćelijska membrana|ćelijske membrane]], kao i u proteinima koji vezuju [[hidrofobnost|hidrofobne]] [[ligand]]e unutar barelnog centra, na primer u lipokalinima. Porinu slične barelne strukture kodira mnoštvo gena, do 2–3% gena kod [[Gram-negativna|gram-negativnih]] bakterija.<ref name="Wimley">{{Cite journal|doi=10.1016/S0959-440X(03)00099-X | last=Wimley | first = WC. |year=2003 | title = The versatile beta-barrel membrane protein | url = | journal = Curr Opin Struct Biol | volume = 13 | issue = 4
U mnogim slučajevima lanci sadrže naizmenične [[hemijska polarnost|polarne]] i [[Hidrofobnost|hidrofobne]] [[aminokiselina|aminokiseline]], pri čemu su hidrofobni ostaci orijentisani ka unutrašnjosti barela i formiraju [[Hidrofobni efekat|hidrofobno jezgro]], dok su polarni ostaci orijentisani ka spoljašnjoj površini barela koja je u dodiru sa rastvaračem. Porini i drugi [[membranski protein]]i koji sadrže beta barele imaju reverzni patern, tako da su hodrofobni ostaci orijentisani ka spoljašnjosti gde su u kontaktu sa okružujućim [[lipid]]ima, dok su hidrofilni ostaci orijentisani kao unutrašnjosti pore.
Beta-bareli se mogu klasifikovati na osnovu dva celobrojna parametra: broju lanaca u beta-ravni, -{''n''}-, i „broja zakrivljenosti“, -{''S''}-, meri zanošenja lanaca u beta-ravni.<ref>{{cite journal|vauthors=Murzin A, Lesk A, Chothia C |title=Principles determining the structure of beta-sheet barrels in proteins. I. A theoretical analysis |journal=J Mol Biol |volume=236 |issue=5 |year=1994 |pmid=8126726 |doi=10.1016/0022-2836(94)90064-7|pages=1369-81}}</ref> Ta dva parametra (-{''n''}- i -{''S''}-) su srodna sa uglom inklanacije beta lanaca relativno na osu barela.<ref>{{cite journal|vauthors=Murzin A, Lesk A, Chothia C |title=Principles determining the structure of beta-sheet barrels in proteins. II. The observed structures |journal=J Mol Biol |volume=236 |issue=5 |year=1994 |pmid=8126727 |doi=10.1016/0022-2836(94)90065-5|pages=1382-400}}</ref><ref name="Liu">{{Cite journal|doi=10.1006/jmbi.1997.1501 | last=Liu | first = WM. |year=1998 | title = Shear numbers of protein beta-barrels: definition refinements and statistics | url = | journal = J Mol Biol | volume = 275 | issue = 4
== Reference ==
Ред 12:
== Literatura ==
* Branden C, Tooze J. ''Introduction to Protein Structure'' 2nd ed. Garland Publishing: New York, NY. {{page|year=1999|
== Spoljašnje veze ==
| |||