Proteinska banka podataka — разлика између измена
Садржај обрисан Садржај додат
мНема описа измене |
мНема описа измене |
||
Ред 1:
'''Proteinska banka podataka''', ({{jez-eng-lat|Protein Data Bank}}, '''PDB'''), je kolekcija 3D strukturnih podataka velikih bioloških molekula, kao što su [[protein]]i i [[nukleinska kiselina|nukleinske kiseline]]. Podaci su tipično dobijeni [[Rendgenska strukturna analiza|rendgenskom strukturnom analizom]] ili [[Proteinska nuklearno magnetska rezonantna spektroskopija|NMR spektroskopijom]]. [[biologija|Biolozi]] i [[biohemija|biohemičari]] iz celog sveta doprinose stvaranju ove kolekcije. PDB je slobodno dostupan na Internetu. PDB nadzire organizacija pod nazivom ''Svetska proteinska banka podataka'' ({{jez-eng-lat|Worldwide Protein Data Bank}}, -{'''wwPDB'''}-).
PDB je ključni resurs u [[strukturna biologija|strukturno biološkim]] oblastima, poput [[strukturna genomika|strukturne genomike]]. Većina vodećih naučnih časopisa, i pojedine agencije za finansiranje, kao što je [[NIH]] u [[SAD]], zahtevaju od istraživača da unesu njihove strukturne podatke u PDB. Ako se PDB sadržaj smatra primarnim podacima, onda postoje stotine izvedenih baza podataka koje kategorizuju podatke na razne načine. Na primer, [[Strukturna klasifikacija proteina|SCOP]] i [[CATH]] kategorizuju strukture na osnovu strukturno tipa i predpostavljenih evolucionih odnosa; a [[Ontologija gena|GO]] kategorizuje strukture na osnovu gena.<ref name = "Historical">{{cite journal | first = H. M. | last = Berman | authorlink = | coauthors = | year = 2008 | month = January | date = | title = The Protein Data Bank: a historical perspective | quotes = | pmid = 18156675| journal = Acta Crystallographica Section A: Foundations of Crystallography | volume = A64 | issue = 1 | pages = 88–95 | doi = 10.1107/S0108767307035623 | id = | url = http://journals.iucr.org/a/issues/2008/01/00/sc5004/sc5004.pdf }}</ref>
| |||