Strukturna klasifikacija proteina — разлика између измена

м
нема резимеа измене
м
м
'''Strukturna klasifikacija proteina''', {{jez-eng-lat|Structural Classification of Proteins}} (SCOP), je baza podataka koja prvenstveno sadrži manualnu klasifikacija proteinskih [[strukturni domen|strukturnih domena]]. Ona je bazirana na sličnosti njihovih [[aminokiselina|aminokiselinskih]] [[proteinska sekvenca|sekvenci]] i tri-dimenzionih [[proteinska struktura|struktura]]. Originalno je objavljena [[1995]].<ref name="pmid7723011">{{cite journal | author = Murzin AG, Brenner SE, Hubbard T, Chothia C | title = SCOP: a structural classification of proteins database for the investigation of sequences and structures | journal = J. Mol. Biol. | volume = 247 | issue = 4 | pages = 536–40 | year = 1995 | pmid = 7723011 | doi = 10.1006/jmbi.1995.0159 }}</ref> i obično se ažurira jednom godišnje. Održavaju je Alexej Murzin i njegove kolege,<ref name="pmid11752311">{{cite journal | author = Lo Conte L, Brenner SE, Hubbard TJ, Chothia C, Murzin AG | title = SCOP database in 2002: refinements accommodate structural genomics | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 30 | issue = 1 | pages = 264–7 | year = 2002 | pmid = 11752311 | doi = 10.1093/nar/30.1.264 | pmc = 99154 }}</ref><ref name="pmid14681400">{{cite journal | author = Andreeva A, Howorth D, Brenner SE, Hubbard TJ, Chothia C, Murzin AG | title = SCOP database in 2004: refinements integrate structure and sequence family data | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 32 | issue = Database issue | pages = D226–9 | year = 2004 | pmid = 14681400 | doi = 10.1093/nar/gkh039 | pmc = 308773 }}</ref>.
 
==Hijerarhijska struktura==
 
SCOP sadrži četiri nivoa hijerarhijske strukturne [[kategorizacija|klasifikacije]]:
# '''klasa''' - generalna "strukturna arhitektura" domena
# '''nabor''' - slična organizacija regularne sekundarne strukture ali bez evidencije o evolucionoj povezanosti
# '''superfamilija''' - dovoljna strukturna i funkciona sličnost da se izvede zaključak o divergentnoj evolucijskoj vezi, mada [[Homologija (biologija)|homologija]] sekvenci ne postoji
# '''familija''' - sličnost sekvenci se može detektovati
 
==Vidi isto==