Омикрон (вирус) — разлика између измена

'''Омикрон'''  је нова варијанта [[САРС-КоВ-2]], [[Вирус|вируса]] који изазива [[ковид 19]] у бројним земљама. Омикрон ''(енг SARS-CoV-2 Omicron variant (В.1.1.529)'' према досадашњим открићима научника има невиђено велики број мутација у делу свог генома који кодира кључни део његовог шиљастог протеина, који вирус користи да инфицира ћелије домаћина. Ово откриће наговештава да би Омикрон могао да избегне део имунолошке заштите коју пружају [[Вакцина|вакцине]], од којих су многе засноване на оригиналном спика протеину и прошлим [[Инфекција|инфекцијама]].<ref name=":0">{{Cite web|url=https://www.medicalnewstoday.com/articles/covid-19-why-the-omicron-variant-has-scientists-worried|title=Omicron variant: Why are scientists worried?|date=2021-12-07|website=www.medicalnewstoday.com|language=en|access-date=2021-12-14}}</ref>

 

Пројекат ''GISAID'' му је доделио идентификатор кладе ГР/484А,<ref>{{cite web|url=https://www.gisaid.org/|title=In focus|author=<!--Not stated-->|date=28 November 2021|website=gisaid.org|publisher=GISAID|archive-url=https://web.archive.org/web/20210121135255/https://www.gisaid.org/|archive-date=21 January 2021|url-status=live|access-date=28 November 2021|quote=The unique mix of spike amino acid changes in Omicron GR/484A (B.1.1.529) is of interest as it comprises several that were previously known to affect receptor binding and antibody escape.}}</ref> а пројекат ''Nextstrain'' му је доделио идентификатор кладе 21K.<ref name="CoVariants1">{{cite web|url=https://covariants.org/variants/21K.Omicron|title=Variant: 21K (Omicron)|author=<!--Not stated-->|date=28 November 2021|website=covariants.org|publisher=CoVariants|archive-url=https://web.archive.org/web/20211128215406/https://covariants.org/variants/21K.Omicron|archive-date=28 November 2021|url-status=live|access-date=28 November 2021|quote=Variant 21K (Omicron) appears to have arisen in November 2021, possibly in South Africa.}}</ref>

=== Мутације ===

Ова варијанта омикрона има много мутација, од којих су неке забрињавале научнике.<ref>{{Cite web|url=https://www.euronews.com/next/2021/11/29/what-we-know-so-far-about-the-b-1-1-529-covid-variant-causing-concern-in-south-africa|title=Omicron variant poses 'very high' global risk, WHO says|last=Hurst|first=Luke|date=2021-11-29|website=euronews|language=en|access-date=2022-02-19}}</ref> Омикрон варијанта има укупно 60 мутација у поређењу са референтном/предак варијантом: 50 несинонимних мутација, 8 синонимних мутација и 2 некодирајуће мутације.<ref>{{Cite web|url=https://www.forbes.com/sites/williamhaseltine/2021/12/02/omicron-origins/|title=Omicron Origins|last=Haseltine|first=William A.|website=Forbes|language=en|access-date=2022-02-19}}</ref> Тридесет и две мутације утичу на спајк протеин, главну антигену мету антитела насталих инфекцијама и многих вакцина које се широко примењују. Многе од тих мутација нису примећене код других сојева.<ref>{{Cite news|url=https://www.ft.com/content/42c5ff3d-e676-4076-9b9f-7243a00cba5e|title=Omicron: What we know about Covid strain prompting fresh global restrictions|last=Cookson|first=Clive|date=2021-12-20|work=Financial Times|access-date=2022-02-19|last2=Barnes|first2=Oliver}}</ref> Варијанта се карактерише са 30 промена аминокиселина, три мале делеције и једном малом инсерцијом у шиљасти протеин у поређењу са оригиналним вирусом, од којих се 15 налази у домену који везује рецептор (остаци 319–541). Такође носи низ промена и брисања у другим геномским регионима. Додатно, варијанта има три мутације на месту цепања фурина.<ref>{{Cite news|url=https://www.nytimes.com/2021/11/26/health/omicron-variant-vaccines.html|title=New Virus Variant Stokes Concern but Vaccines Still Likely to Work|last=Zimmer|first=Carl|date=2021-11-26|work=The New York Times|access-date=2022-02-19|language=en-US|issn=0362-4331}}</ref> Место цепања фурина повећава инфективност САРС-КоВ-2.<ref>Zhang L, Mann M, Syed ZA, Reynolds HM, Tian E, Samara NL, et al. (November 2021). "Furin cleavage of the SARS-CoV-2 spike is modulated by ''O''-glycosylation". ''Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America''. '''118''' (47): e2109905118. {{cite journal|author= |title= |url= |journal= |date= |doi=10.1073/pnas.2109905118 |pmc=8617502 }}. <nowiki>PMID 34732583</nowiki>. S2CID 242937417.</ref>