Википедија

ENCODE

Enciklopedija DNK elemenata (ENCODE) je javni istraživački konzorcijum[2] koji je uspostavio USA|američki Nacionalni istraživački institut ljudskog genoma (NHGRI) septembra 2003.[1][3][4][5] Njegov primarni cilj je da se nađu svi funkcionalni elementi ljudskog genoma.[6] Podaci generisani u okviru ovog projekta se deponuju u javne baze podataka.

ENCODE
Kontent
OpisBaza podataka celog genoma
Kontakt
Istraživački centarKalifornijski univerzitet Santa Kruz
LaboratorijaCenter za biomolekularne nauke i inženjestvo
AutoriBrian J Raney[1]
Primarni citatPMID 21037257
Pristup
Veb stranicaencodeproject.org
Alati
Razno

Inicijalni rezultati projekta su objavljeni 5. septembra 2012. u koordiniranoj grupi od 30 članaka objavljenih u žurnalima Nature (6 publikacija), Genome Biology (18 publikacija), i Genome Research (6 publikacija).[7][8] U publikaciji sa pregledom projekta se navodi da su poznate biohemijske funkcije za 80% ljudskog genoma.[9][10] Znatan deo funkcionalne nekodirajuće DNK učestvuje u regulaciji ekspresije kodirajućih gena.[9] Izražavanje kodirajućih gena je kontrolisano višestrukim rebulatornim mestima, koja mogu da budu locirana u blizini ili na znatnoj razdaljini od gena. Ovi resultati demonstriraju da je regulacija gena daleko kompleksnija nego što se ranije verovalo.[11]

Reference уреди

  1. ^ а б Raney, BJ; Cline, MS; Rosenbloom, KR; Dreszer, TR; Learned, K; Barber, GP; Meyer, LR; Sloan, CA; Malladi, VS; Roskin KM; Suh BB; Hinrichs AS; Clawson H; Zweig AS; Kirkup V; Fujita PA; Rhead B; Smith KE; Pohl A; Kuhn RM; Karolchik D; Haussler D; Jim Kent (2011). „ENCODE whole-genome data in the UCSC genome browser (2011 update)”. Nucleic Acids Research. 39 (Database issue): D871—5. PMC 3013645  . PMID 21037257. doi:10.1093/nar/gkq1017. 
  2. ^ Maher, B. (2012). „ENCODE: The human encyclopaedia”. Nature. 489 (7414): 46—8. PMID 22962707. doi:10.1038/489046a. 
  3. ^ ENCODE Project Consortium (2011). Becker PB, ур. „A User's Guide to the Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE)”. PLoS Biology. 9 (4): e1001046. PMC 3079585  . PMID 21526222. doi:10.1371/journal.pbio.1001046. 
  4. ^ Consortium, ENCODE Project; Birney, Ewan; Stamatoyannopoulos, JA; Dutta, A; Guigó, R; Gingeras, TR; Margulies, EH; Weng, Z; Snyder, M; Dermitzakis ET; et al. (2007). „Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project”. Nature. 447 (7146): 799—816. Bibcode:2007Natur.447..799B. PMC 2212820  . PMID 17571346. doi:10.1038/nature05874. 
  5. ^ Guigó, R; Flicek, P; Abril, JF; Reymond, A; Lagarde, J; Denoeud, F; Antonarakis, S; Ashburner, M; Bajic, VB; Ewan Birney; Castelo R; Eyras E; Ucla C; Gingeras TR; Harrow J; Hubbard T; Lewis SE; Reese MG (2006). „EGASP: The human ENCODE Genome Annotation Assessment Project”. Genome Biology. 7: S2. PMC 1810551  . PMID 16925836. doi:10.1186/gb-2006-7-s1-s2. 
  6. ^ National Human Genome Research Institute. „The ENCODE Project: ENCyclopedia Of DNA Elements”. U.S. National Institutes of Health. 
  7. ^ „ENCODE project at UCSC”. ENCODE Consortium. Приступљено 5. 9. 2012. 
  8. ^ Walsh, F. (5. 9. 2012). „Detailed map of genome function”. BBC News. Архивирано из оригинала 05. 09. 2012. г. Приступљено 6. 9. 2012. 
  9. ^ а б Bernstein BE, Birney E, Dunham I, Green ED, Gunter C, Snyder M (2012). „An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome”. Nature. 489 (7414): 57—74. Bibcode:2012Natur.489...57T. PMID 22955616. doi:10.1038/nature11247. 
  10. ^ Timmer, J. (10. 9. 2012). „Most of what you read was wrong: how press releases rewrote scientific history”. Staff / From the Minds of Ars. Ars Technica. Приступљено 10. 9. 2012. 
  11. ^ Pennisi, E. (2012). „Genomics. ENCODE project writes eulogy for junk DNA”. Science. 337 (6099): 1159, 1161. PMID 22955811. doi:10.1126/science.337.6099.1159. 

Vidi još уреди

Spoljašnje veze уреди

Преузето из „https://sr.wikipedia.org/w/index.php?title=ENCODE&oldid=26740140”