KEGG (Kjoto enciklopedija gena i genoma) je kolekcija onlajn baza podataka koje obuhvataju oblasti genoma, enzimatskih puteva, i bioloških jedinjenja. PATHWAY baza podataka sadrži mrežu molekulskih interakcija u ćelijama, i njihovih varijanti u specifičnim organizmima.

Istorija

уреди

Japanski program za ljudski genom je osnovao KEGG, Kjoto enciklopediju gena i genoma, 1995. godine[1]. Njeni osnivači smatraju KEGG "računarskom reprezentacijom" biološkog sistema[2]. KEGG nalazi primenu u modelovanju i simulacijama, kao i u pregledu i pretraživanju podataka. On je komponenta sistemsko biološkog pristupa.

KEGG sadrži pet glavnih baza podataka:[3]

  • KEGG Atlas
  • KEGG Put
  • KEGG Geni
  • KEGG Ligand
  • KEGG BRITE

Vidi još

уреди

Literatura

уреди
  1. ^ Kanehisa M (1997). „A database for post-genome analysis.”. Trends Genet. 13 (9): 375—6. PMID 9287494. 
  2. ^ Kanehisa M; Goto S; Hattori M; Aoki-Kinoshita KF; Itoh M; Kawashima S; et al. (2006). „From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG.”. Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D354—7. PMC 1347464 . PMID 16381885. doi:10.1093/nar/gkj102. 
  3. ^ Kanehisa M, Goto S, Kawashima S, Okuno Y, Hattori M (2004). „The KEGG resource for deciphering the genome.”. Nucleic Acids Res. 32 (Database issue): D277—80. PMC 308797 . PMID 14681412. doi:10.1093/nar/gkh063. 

Spoljašnje veze

уреди