Proteinsko savijanje

Proteinsko savijanje ili folding proteina je proces kojim protein zauzima svoju funkcionalnu prostornu strukturu ili konformaciju. To je fizički proces kojim polipeptid zauzima svoju karakterističnu i funkcionalnu tridimenzionalnu strukturu.^[1] Protein pri nastanku odnosno translaciji iz iRNK napušta ribozom kao linearni nesavijeni lanac aminokiselina. Međutim već u toku procesa translacije međusobna interakcija aminokiselina novonastalog peptida proizvodi definisanu tridimenzionu strukturu foldovanog proteina poznatu kao nativna konformacija. Rezultujuća trodimenzionalna struktura je određena aminokiselinskom sekvencom (Anfinsenova dogma).^[2]

Korektna trodimenzionalna struktura je esencijalna za funkciju, mada neki delovi funkcionalnih proteina mogu da ostanu nesavijeni.^[3] Posledica neuspešnog foldinga u nativnu konformaciju je neaktivni i nefunkcionalni protein, koji je obično toksičan. Pogrešno foldovani proteini često nisu hidrosolubilni, pa međusobno formiraju hidrofobne agregate pod opštim imenom amiloidi. Nekoliko neurodegenerativnih i drugih bolesti su uzrokovane akumulacijom amiloidnih filamenata formiranih od nekorektno savijenih proteina.^[4] Mnoge alergije su posledica proteinskog foldinga, jer imunski sistem zbog greške u koformaciji proteina ne proizvodi funkcionalna antitela.^[5]

Vidi još уреди

Reference уреди

^ Alberts Bruce; Alexander Johnson; Julian Lewis; Martin Raff; Keith Roberts & Peter Walters (2002). „The Shape and Structure of Proteins”. Molecular Biology of the Cell; Fourth Edition. New York and London: Garland Science. ISBN 0-8153-3218-1.
^ Anfinsen, C. (1972). „The formation and stabilization of protein structure”. Biochem. J. 128 (4): 737—49. PMC 1173893  . PMID 4565129.
^ Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer; Web content by Neil D. Clarke (2002). „3. Protein Structure and Function”. Biochemistry. San Francisco: W. H. Freeman. ISBN 0-7167-4684-0.
^ Selkoe, Dennis J. (2003). „Folding proteins in fatal ways”. Nature. 426 (6968): 900—904. PMID 14685251. doi:10.1038/nature02264.
^ Alberts, Bruce, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walter. "Protein Structure and Function." Essential Cell Biology. Edition 3. New York: Garland Science, Taylor and Francis Group, LLC, 2010. Pg 120-170.

Literatura уреди

Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer; Web content by Neil D. Clarke (2002). „3. Protein Structure and Function”. Biochemistry. San Francisco: W. H. Freeman. ISBN 0-7167-4684-0.
Alberts Bruce; Alexander Johnson; Julian Lewis; Martin Raff; Keith Roberts & Peter Walters (2002). „The Shape and Structure of Proteins”. Molecular Biology of the Cell; Fourth Edition. New York and London: Garland Science. ISBN 0-8153-3218-1.

Spoljašnje veze уреди

FoldIt - igra savijanja proteina Архивирано на сајту Wayback Machine (4. јануар 2021)
Folding@Home Архивирано на сајту Wayback Machine (16. јун 2008)
Rosetta@Home

[Alberts-1] Alberts Bruce; Alexander Johnson; Julian Lewis; Martin Raff; Keith Roberts & Peter Walters (2002). „The Shape and Structure of Proteins”. Molecular Biology of the Cell; Fourth Edition. New York and London: Garland Science. ISBN 0-8153-3218-1.

[Anfinsen-2] Anfinsen, C. (1972). „The formation and stabilization of protein structure”. Biochem. J. 128 (4): 737—49. PMC 1173893  . PMID 4565129.

[3] Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer; Web content by Neil D. Clarke (2002). „3. Protein Structure and Function”. Biochemistry. San Francisco: W. H. Freeman. ISBN 0-7167-4684-0.

[Selkoe:03-4] Selkoe, Dennis J. (2003). „Folding proteins in fatal ways”. Nature. 426 (6968): 900—904. PMID 14685251. doi:10.1038/nature02264.

[5] Alberts, Bruce, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walter. "Protein Structure and Function." Essential Cell Biology. Edition 3. New York: Garland Science, Taylor and Francis Group, LLC, 2010. Pg 120-170.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]