Лимфотоксин бета рецептор

Лимфотоксин бета рецептор (TNFR superfamilija, član 3)
Лимфотоксин бета рецептор (TNFR superfamilija, član 3)
	Kristalografska struktura peptida sa 24 ostatka iz limfotoksin-B receptora vezanog za TRAF3.
Dostupne strukture
	1RF3
Identifikatori
Simboli	LTBR; CD18; D12S370; LT-BETA-R; TNF-R-III; TNFCR; TNFR-RP; TNFR2-RP; TNFRSF3
Vanjski ID	OMIM: 600979 MGI: 104875 HomoloGene: 1753 GeneCards: LTBR Gene
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• aktivnost transmembranskog receptora; • proteinsko vezivanje;
Celularna komponenta	• membrana; • integralno sa membranom;
Biološki proces	• apoptoza; • imunski respons; • prenos signala; • positivna regulacija I-kapaB киназа/NF-kapaB каскаде;
Преглед РНК изражавања
	подаци
Ортолози
Врста	Човек
Ентрез	4055
Енсембл	ЕНСГ00000111321
УниПрот	П36941
РефСеq (мРНА)	НМ_002342
РефСеq (протеин)	НП_002333
Локација (УЦСЦ)	Цхр 12:; 6.36 - 6.37 Мб
ПубМед претрага	[1]

Референце уреди

^ ’PDB: 1РФ3; Ли C, Норрис ПС, Ни ЦЗ, Хаверт ML, Цхионг ЕМ, Тран БР, Цабезас Е, Реед ЈЦ, Саттертхwаит АЦ, Wаре ЦФ, Елy КР (2003). „Струцтураллy дистинцт рецогнитион мотифс ин лyмпхотоxин-бета рецептор анд ЦД40 фор тумор нецросис фацтор рецептор-ассоциатед фацтор (ТРАФ)-медиатед сигналинг”. Ј. Биол. Цхем. 278 (50): 50523—9. ПМИД 14517219. дои:10.1074/јбц.М309381200.

Лимфотоксин бета рецептор је рецептор за лимфотоксин који је код људи кодиран LTBR геном.^[1]^[2]^[3]

Функција уреди

Протеин кодиран овим геном је члан TNF фамилије рецептора. Он је изражен на површини већине ћелијских типова, укључујући ћелије епителног и мијелоидног порекла, али не на Т и Б лимфоцитима. Овај протеин специфично везује лимфотоксин мембранску форму (комплекс лимфотоксина-алфа и лимфтоксина-бета се формира). Лимфтоксин-бета и његов лиганд учествују у развоју и организацији лимфоидног ткива. Активација овог протеина може да подстакне апоптозу.^[1]

Не самп да LTBR помаже у подстицању апоптозе, он може да доведе до ослобађања цитокина интерлеукин 8. Прекомерно LTBR изражавање у HEK293 ћелима повећава IL-8 промоторску активност, и доводи до IL-8 ослобађања. LTBR је такође есенцијалан за развој и организацију секундарних лимфоидних органа и ослобађање других хемокина.^[4]

Структура уреди

Рамачандранов дијаграм показује да је 64.6% остатака у пожељном региону.^[5] Ова струцтура је установљена путем дифракције X-зрака. Њена резолуција је 3.50 Å. Алфа и бета углови су 90 степени, док је гама угао 120 степени.

Интеракције уреди

За лимфотоксин бета рецептор је било показано да интерагује са Дијабло хомологом^[6] и TRAF3.^[7]^[8]^[9]

Референце уреди

^ ^а ^б „Ентрез Гене: ЛТБР лyмпхотоxин бета рецептор (ТНФР суперфамилy, мембер 3)”.
^ Баенс M, Цхаффанет M, Цассиман ЈЈ, ван ден Бергхе Х, Марyнен П (1993). „Цонструцтион анд евалуатион оф а хнцДНА либрарy оф хуман 12п трансцрибед сеqуенцес деривед фром а соматиц целл хyбрид”. Геномицс. 16 (1): 214—8. ПМИД 8486360. дои:10.1006/гено.1993.1161.
^ Цроwе ПД, ВанАрсдале ТЛ, Wалтер БН, Wаре ЦФ, Хессион C, Ехренфелс Б, Броwнинг ЈЛ, Дин WС, Гоодwин РГ, Смитх ЦА (1994). „А лyмпхотоxин-бета-специфиц рецептор”. Сциенце (јоурнал). 264 (5159): 707—10. ПМИД 8171323. дои:10.1126/сциенце.8171323.
^ Цханг YХ, Хсиех СЛ, Цхен MC, Лин WW (2002). „Лyмпхотоxин бета рецептор индуцес интерлеукин 8 гене еxпрессион виа НФ-каппаБ анд АП-1 ацтиватион”. Еxп. Целл Рес. 278 (2): 166—74. ПМИД 12169272. дои:10.1006/еxцр.2002.5573.
^ „МолПробитy Рамацхандран аналyсис” (ПДФ). Архивирано из оригинала (ПДФ) 12. 10. 2012. г.
^ Куаи, Јун; Ницкбарг Еллиотт; et al. (2003). „Ендогеноус ассоциатион оф ТРАФ2, ТРАФ3, цИАП1, анд Смац wитх лyмпхотоxин бета рецептор ревеалс а новел мецханисм оф апоптосис”. Ј. Биол. Цхем. Унитед Статес. 278 (16): 14363—9. ИССН 0021-9258. ПМИД 12571250. дои:10.1074/јбц.М208672200.
^ ВанАрсдале, Т L; ВанАрсдале С L; et al. (1997). „Лyмпхотоxин-бета рецептор сигналинг цомплеx: роле оф тумор нецросис фацтор рецептор-ассоциатед фацтор 3 рецруитмент ин целл деатх анд ацтиватион оф нуцлеар фацтор каппаБ”. Проц. Натл. Ацад. Сци. У.С.А. УНИТЕД СТАТЕС. 94 (6): 2460—5. ИССН 0027-8424. ПМЦ 20110  . ПМИД 9122217. дои:10.1073/пнас.94.6.2460.
^ Wу, M Y; Wанг П Y; et al. (1999). „Тхе цyтопласмиц домаин оф тхе лyмпхотоxин-бета рецептор медиатес целл деатх ин ХеЛа целлс”. Ј. Биол. Цхем. УНИТЕД СТАТЕС. 274 (17): 11868—73. ИССН 0021-9258. ПМИД 10207006. дои:10.1074/јбц.274.17.11868.
^ Марстерс, С А; Аyрес Т M; et al. (1997). „Херпесвирус ентрy медиатор, а мембер оф тхе тумор нецросис фацтор рецептор (ТНФР) фамилy, интерацтс wитх мемберс оф тхе ТНФР-ассоциатед фацтор фамилy анд ацтиватес тхе трансцриптион фацторс НФ-каппаБ анд АП-1”. Ј. Биол. Цхем. УНИТЕД СТАТЕС. 272 (22): 14029—32. ИССН 0021-9258. ПМИД 9162022. дои:10.1074/јбц.272.22.14029.

Литература уреди

Елеwаут D, Wаре ЦФ (2007). „Тхе унцонвентионал роле оф ЛТ алпха бета ин Т целл дифферентиатион.”. Трендс Иммунол. 28 (4): 169—75. ПМИД 17336158. дои:10.1016/ј.ит.2007.02.005.
Броwнинг ЈЛ; Нгам-ек А; Лаwтон П; et al. (1993). „Лyмпхотоxин бета, а новел мембер оф тхе ТНФ фамилy тхат формс а хетеромериц цомплеx wитх лyмпхотоxин он тхе целл сурфаце.”. Целл. 72 (6): 847—56. ПМИД 7916655. дои:10.1016/0092-8674(93)90574-А.
Цроwе ПД; ВанАрсдале ТЛ; Wалтер БН; et al. (1994). „А лyмпхотоxин-бета-специфиц рецептор.”. Сциенце. 264 (5159): 707—10. ПМИД 8171323. дои:10.1126/сциенце.8171323.
Баенс M; Цхаффанет M; Цассиман ЈЈ; et al. (1993). „Цонструцтион анд евалуатион оф а хнцДНА либрарy оф хуман 12п трансцрибед сеqуенцес деривед фром а соматиц целл хyбрид.”. Геномицс. 16 (1): 214—8. ПМИД 8486360. дои:10.1006/гено.1993.1161.
Баенс M; Аерссенс Ј; ван Занд К; et al. (1996). „Исолатион анд регионал ассигнмент оф хуман цхромосоме 12п цДНАс.”. Геномицс. 29 (1): 44—52. ПМИД 8530100. дои:10.1006/гено.1995.1213.
Wанг X; Борнслаегер ЕА; Хауб О; et al. (1996). „А цандидате гене фор тхе амнионлесс гаструлатион стаге моусе мутатион енцодес а ТРАФ-релатед протеин.”. Дев. Биол. 177 (1): 274—90. ПМИД 8660894. дои:10.1006/дбио.1996.0162.
Накано Х; Осхима Х; Цхунг W; et al. (1996). „ТРАФ5, ан ацтиватор оф НФ-каппаБ анд путативе сигнал трансдуцер фор тхе лyмпхотоxин-бета рецептор.”. Ј. Биол. Цхем. 271 (25): 14661—4. ПМИД 8663299. дои:10.1074/јбц.271.25.14661.
Матсумото M; Хсиех ТY; Зху Н; et al. (1997). „Хепатитис C вирус цоре протеин интерацтс wитх тхе цyтопласмиц таил оф лyмпхотоxин-бета рецептор.”. Ј. Вирол. 71 (2): 1301—9. ПМЦ 191185  . ПМИД 8995654.
ВанАрсдале ТЛ; ВанАрсдале СЛ; Форце WР; et al. (1997). „Лyмпхотоxин-бета рецептор сигналинг цомплеx: роле оф тумор нецросис фацтор рецептор-ассоциатед фацтор 3 рецруитмент ин целл деатх анд ацтиватион оф нуцлеар фацтор каппаБ.”. Проц. Натл. Ацад. Сци. У.С.А. 94 (6): 2460—5. ПМЦ 20110  . ПМИД 9122217. дои:10.1073/пнас.94.6.2460.
Wу МY; Хсу ТЛ; Лин WW; et al. (1997). „Серине/тхреонине кинасе ацтивитy ассоциатед wитх тхе цyтопласмиц домаин оф тхе лyмпхотоxин-бета рецептор ин ХепГ2 целлс.”. Ј. Биол. Цхем. 272 (27): 17154—9. ПМИД 9202035. дои:10.1074/јбц.272.27.17154.
Цхен CM, Yоу ЛР, Хwанг ЛХ, Лее YХ (1997). „Дирецт интерацтион оф хепатитис C вирус цоре протеин wитх тхе целлулар лyмпхотоxин-бета рецептор модулатес тхе сигнал патхwаy оф тхе лyмпхотоxин-бета рецептор.”. Ј. Вирол. 71 (12): 9417—26. ПМЦ 230246  . ПМИД 9371602.
Мизусхима С; Фујита M; Исхида Т; et al. (1998). „Цлонинг анд цхарацтеризатион оф а цДНА енцодинг тхе хуман хомолог оф тумор нецросис фацтор рецептор-ассоциатед фацтор 5 (ТРАФ5).”. Гене. 207 (2): 135—40. ПМИД 9511754. дои:10.1016/С0378-1119(97)00616-1.
Крајеwска M; Крајеwски С; Запата ЈМ; et al. (1998). „ТРАФ-4 еxпрессион ин епитхелиал прогенитор целлс. Аналyсис ин нормал адулт, фетал, анд тумор тиссуес.”. Ам. Ј. Патхол. 152 (6): 1549—61. ПМЦ 1858434  . ПМИД 9626059.
Боуссауд V; Солер П; Мореау Ј; et al. (1999). „Еxпрессион оф тхрее мемберс оф тхе ТНФ-Р фамилy оф рецепторс (4-1ББ, лyмпхотоxин-бета рецептор, анд Фас) ин хуман лунг.”. Еур. Респир. Ј. 12 (4): 926—31. ПМИД 9817170. дои:10.1183/09031936.98.12040926.
Мурпхy M; Wалтер БН; Пике-Нобиле L; et al. (1999). „Еxпрессион оф тхе лyмпхотоxин бета рецептор он фоллицулар стромал целлс ин хуман лyмпхоид тиссуес.”. Целл Деатх Диффер. 5 (6): 497—505. ПМИД 10200501. дои:10.1038/сј.цдд.4400374.
Wу МY, Wанг ПY, Хан СХ, Хсиех СЛ (1999). „Тхе цyтопласмиц домаин оф тхе лyмпхотоxин-бета рецептор медиатес целл деатх ин ХеЛа целлс.”. Ј. Биол. Цхем. 274 (17): 11868—73. ПМИД 10207006. дои:10.1074/јбц.274.17.11868.
Yу КY; Кwон Б; Ни Ј; et al. (1999). „А неwлy идентифиед мембер оф тумор нецросис фацтор рецептор суперфамилy (ТР6) суппрессес ЛИГХТ-медиатед апоптосис.”. Ј. Биол. Цхем. 274 (20): 13733—6. ПМИД 10318773. дои:10.1074/јбц.274.20.13733.
Роонеy ИА; Бутровицх КД; Гласс АА; et al. (2000). „Тхе лyмпхотоxин-бета рецептор ис нецессарy анд суффициент фор ЛИГХТ-медиатед апоптосис оф тумор целлс.”. Ј. Биол. Цхем. 275 (19): 14307—15. ПМИД 10799510. дои:10.1074/јбц.275.19.14307.
Лангегген Х, Берге КЕ, Јохнсон Е, Хетланд Г (2003). „Хуман умбилицал веин ендотхелиал целлс еxпресс цомплемент рецептор 1 (ЦД35) анд цомплемент рецептор 4 (ЦД11ц/ЦД18) ин витро.”. Инфламматион. 26 (3): 103—10. ПМИД 12083416. дои:10.1023/А:1015585530204.
Цханг YХ, Хсиех СЛ, Цхен MC, Лин WW (2002). „Лyмпхотоxин бета рецептор индуцес интерлеукин 8 гене еxпрессион виа НФ-каппаБ анд АП-1 ацтиватион.”. Еxп. Целл Рес. 278 (2): 166—74. ПМИД 12169272. дои:10.1006/еxцр.2002.5573.

Спољашње везе уреди

Лyмпхотоxин+бета+Рецептор на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

[pmid14517219-1] ’PDB: 1РФ3; Ли C, Норрис ПС, Ни ЦЗ, Хаверт ML, Цхионг ЕМ, Тран БР, Цабезас Е, Реед ЈЦ, Саттертхwаит АЦ, Wаре ЦФ, Елy КР (2003). „Струцтураллy дистинцт рецогнитион мотифс ин лyмпхотоxин-бета рецептор анд ЦД40 фор тумор нецросис фацтор рецептор-ассоциатед фацтор (ТРАФ)-медиатед сигналинг”. Ј. Биол. Цхем. 278 (50): 50523—9. ПМИД 14517219. дои:10.1074/јбц.М309381200.

[entrez-2] а ^б „Ентрез Гене: ЛТБР лyмпхотоxин бета рецептор (ТНФР суперфамилy, мембер 3)”.

[pmid8486360-3] Баенс M, Цхаффанет M, Цассиман ЈЈ, ван ден Бергхе Х, Марyнен П (1993). „Цонструцтион анд евалуатион оф а хнцДНА либрарy оф хуман 12п трансцрибед сеqуенцес деривед фром а соматиц целл хyбрид”. Геномицс. 16 (1): 214—8. ПМИД 8486360. дои:10.1006/гено.1993.1161.

[pmid8171323-4] Цроwе ПД, ВанАрсдале ТЛ, Wалтер БН, Wаре ЦФ, Хессион C, Ехренфелс Б, Броwнинг ЈЛ, Дин WС, Гоодwин РГ, Смитх ЦА (1994). „А лyмпхотоxин-бета-специфиц рецептор”. Сциенце (јоурнал). 264 (5159): 707—10. ПМИД 8171323. дои:10.1126/сциенце.8171323.

[pmid12169272-5] Цханг YХ, Хсиех СЛ, Цхен MC, Лин WW (2002). „Лyмпхотоxин бета рецептор индуцес интерлеукин 8 гене еxпрессион виа НФ-каппаБ анд АП-1 ацтиватион”. Еxп. Целл Рес. 278 (2): 166—74. ПМИД 12169272. дои:10.1006/еxцр.2002.5573.

[6] „МолПробитy Рамацхандран аналyсис” (ПДФ). Архивирано из оригинала (ПДФ) 12. 10. 2012. г.

[pmid12571250-7] Куаи, Јун; Ницкбарг Еллиотт; et al. (2003). „Ендогеноус ассоциатион оф ТРАФ2, ТРАФ3, цИАП1, анд Смац wитх лyмпхотоxин бета рецептор ревеалс а новел мецханисм оф апоптосис”. Ј. Биол. Цхем. Унитед Статес. 278 (16): 14363—9. ИССН 0021-9258. ПМИД 12571250. дои:10.1074/јбц.М208672200.

[pmid9122217-8] ВанАрсдале, Т L; ВанАрсдале С L; et al. (1997). „Лyмпхотоxин-бета рецептор сигналинг цомплеx: роле оф тумор нецросис фацтор рецептор-ассоциатед фацтор 3 рецруитмент ин целл деатх анд ацтиватион оф нуцлеар фацтор каппаБ”. Проц. Натл. Ацад. Сци. У.С.А. УНИТЕД СТАТЕС. 94 (6): 2460—5. ИССН 0027-8424. ПМЦ 20110  . ПМИД 9122217. дои:10.1073/пнас.94.6.2460.

[pmid10207006-9] Wу, M Y; Wанг П Y; et al. (1999). „Тхе цyтопласмиц домаин оф тхе лyмпхотоxин-бета рецептор медиатес целл деатх ин ХеЛа целлс”. Ј. Биол. Цхем. УНИТЕД СТАТЕС. 274 (17): 11868—73. ИССН 0021-9258. ПМИД 10207006. дои:10.1074/јбц.274.17.11868.

[pmid9162022-10] Марстерс, С А; Аyрес Т M; et al. (1997). „Херпесвирус ентрy медиатор, а мембер оф тхе тумор нецросис фацтор рецептор (ТНФР) фамилy, интерацтс wитх мемберс оф тхе ТНФР-ассоциатед фацтор фамилy анд ацтиватес тхе трансцриптион фацторс НФ-каппаБ анд АП-1”. Ј. Биол. Цхем. УНИТЕД СТАТЕС. 272 (22): 14029—32. ИССН 0021-9258. ПМИД 9162022. дои:10.1074/јбц.272.22.14029.

[1]

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]