Imunoglobulinski domen

Imunoglobulinski domen je tip proteinskog domena koji se sastoji od dvoslojnog sendviča sa 7 i 9 antiparalelnih β-lanaca koji formiraju β-ravni sa topologijom Grčkog kluča.[1][2]

IImunoglobulinski domen
PDB 8fab EBI.jpg
Struktura fragmenta koji se vezuje za antigen antitela
Identifikatori
Simbolig
PfamPF00047
Pfam klanCL0011
InterProIPR013151
PROSITEPDOC00262
SCOP8fab
SUPERFAMILY8fab

Aminokiselinski lanac više puta prelazi iz jedne β-ravni u drugu. Tipičan obrazac je (N-terminalna β-ukosnica u ravni 1)-(β-ukosnica u ravni 2)-(β-lanac u ravni 1)-(C-terminalna β-ukosnica u ravni 2). Prelazi između dve ravni formiraju "X", tako da su N- i C-terminalne ukosnica jedna naspram druge.

Članovi imunoglobulinske superfamilije su prisutni u stotinama proteina sa različitim funkcijama. Primeri tih proteina su antitela, gigantska mišićna kinaza titin i receptorske tirozinske kinaze. Imunoglobulinu slični domeni mogu da učestvujuju u protein–protein i protein–ligand interakcijama.[3]

PrimeriУреди

Ljudski geni koji kodiraju proteine sa imunoglobulinskim domenom:

ReferenceУреди

  1. ^ Bork P, Holm L, Sander C (1994). „The immunoglobulin fold. Structural classification, sequence patterns and common core”. J. Mol. Biol. 242 (4): 309—20. PMID 7932691. doi:10.1006/jmbi.1994.1582. 
  2. ^ Brümmendorf T, Rathjen FG (1995). „Cell adhesion molecules 1: immunoglobulin superfamily”. Protein Profile. 2 (9): 963—1108. PMID 8574878. 
  3. ^ Williams AF, Barclay AN (1988). „The immunoglobulin superfamily—domains for cell surface recognition”. Annu. Rev. Immunol. 6: 381—405. PMID 3289571. doi:10.1146/annurev.iy.06.040188.002121. 

See alsoУреди

Spoljašnje vezeУреди