ЦРАЛ-ТРИО домен
CRAL-TRIO домен је протеински структурни домен који везује мале липофилне молекуле.[2] Тај домен је добио име по ћелијском протеину који везује ретиналдехид (CRALBP) и ТРИО фактору размене гуанина.
| CRAL/TRIO домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Алфа-токоферолни трансфер протеин у затвореном стању са лигандом.[1] | |||||||||
| Идентификатори | |||||||||
| Симбол | CRAL_TRIO | ||||||||
| Пфам | ПФ00650 | ||||||||
| ИнтерПро | ИПР001251 | ||||||||
| СМАРТ | Сец14 | ||||||||
| СЦОП | 1ауа | ||||||||
| СУПЕРФАМИЛY | 1ауа | ||||||||
| ОПМ суперфамилија | 129 | ||||||||
| ОПМ протеин | 1р5л | ||||||||
| |||||||||
CRALB протеин носи 11-цис-ретинол или 11-цис-ретиналдехид. Он посредује интеракцију ретиноида са ензимима визуелног циклуса. ТРИО учествује у координацији актинског ремоделовања, које је неопходно за ћелијску миграцију и раст.
Други чланови фамилије су алфа-токоферолни трансфер протеин и фосфатидилинозитол-трансфер протеин (Сец14). Они транспортују супстрате (алфа-токоферол и фосфатидилинозитол или фосфатидилхолин, респективно) између разних интраћелијских мембрана. Фамилија такође обухвата гуанин нуклеотидни фактор размене који може да функционише као ефектор РАЦ1 малог Г-протеина.
N-терминални домен квашчаног ЕЦМ25 протеина садржи ЦРАЛ-ТРИО домен.[3]
Структура уреди
Sec14 протеин је био први CRAL-TRIO домен чија структура је одређена.[4] Структура садржи неколико алфа хеликса као и бета раван која се састоји од 6 ланаца. Ланци 2, 3, 4 и 5 формирају паралелну бета раван, док су ланци 1 и 6 антипаралелни. Структура такоше има хидрофобно место везивања липида.
Људски протеини који садрже овај домен уреди
C20orf121; MOSPD2; PTPN9; RLBP1; RLBP1L1; RLBP1L2; SEC14L1; SEC14L2; SEC14L3; SEC14L4; TTPA;
Референце уреди
- ^ Мин КЦ, Ковалл РА, Хендрицксон WА (2003). „Црyстал струцтуре оф хуман алпха-тоцопхерол трансфер протеин боунд то итс лиганд: имплицатионс фор атаxиа wитх витамин Е дефициенцy”. Проц. Натл. Ацад. Сци. У.С.А. 100 (25): 14713—8. ПМЦ 299775
. ПМИД 14657365. дои:10.1073/пнас.2136684100.
- ^ Панагабко C; Морлеy С; Хернандез M; et al. (2003). „Ligand specificity in the CRAL-TRIO protein family”. Biochemistry. 42 (21): 6467—74. PMID 12767229. doi:10.1021/bi034086v.
- ^ Gallego O; Betts MJ; Gvozdenovic-Jeremic J; et al. (2010). „А сyстематиц сцреен фор протеин-липид интерацтионс ин Саццхаромyцес церевисиае”. Мол. Сyст. Биол. 6 (1): 430. ПМЦ 3010107 . ПМИД 21119626. дои:10.1038/мсб.2010.87.
- ^ Сха Б, Пхиллипс СЕ, Банкаитис ВА, Луо M (1998). „Црyстал струцтуре оф тхе Саццхаромyцес церевисиае пхоспхатидyлиноситол-трансфер протеин”. Натуре. 391 (6666): 506—10. ПМИД 9461221. дои:10.1038/35179.
Спољашње везе уреди
- UMich оријентација протеина у мембранама фамилиес/суперфамилy-129 - Calculated spatial positions of CRAL-TRIO domains in membrane