ГоЛоцо мотив
GoLoco мотив је протеински структурни мотив.[1][2][3]
GoLoco мотив | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификатори | |||||||||
Симбол | ГоЛоцо | ||||||||
Пфам | ПФ02188 | ||||||||
ИнтерПро | ИПР003109 | ||||||||
СМАРТ | ГоЛоцо | ||||||||
СЦОП | 1кјy | ||||||||
СУПЕРФАМИЛY | 1кјy | ||||||||
|
У хетеротримерној Г-протеинског сигнализацији, рецептори ћелијске површине (Г протеин спрегнути рецептори) су спрегнути са за мембрану везаним хетеротримерима, који се састоје од ГТП-хидролизујућих подјединица Г-алфа и Г-бета/Г-гама димера. Неактивна форма садржи алфа подјединицу везану за ГДП у комплексу са бета и гама подјединицама. Кад се лиганд веже за рецептор, ГДП се замењује у Г-алфа протеину са ГТП. ГТП/Г-алфа комплекс се дисоцира из тримера и везује се за ефектор, све док интринсична ГТПазна активност Г-алфа не врати протеин у ГДП везану форму. Реасоцијација ГДП-везане Г-алфа подјединице са Г-бета/Г-гама димером зауставља сигнал. Неколико механизама регулише излаз сигнала у различитим ступњевима Г-протеинске каскаде. Две класе интраћелијских протеина делују као инхибитори Г протеинске активације: активирајући протеини ГТПазе (ГАП), који повишавају ГТП хидролизу[4], и инхибитори дисоцијације гуанозин нуклеотида (ГДИ), који инхибирају ГДП дисоцијацију. GoLoco, или Г-протеин регулаторни (ГПР), мотив нађен у разним Г-протеин регулаторима[1][5] делује као ГДИ на Г-алфа(и)[2][6].
Структура уреди
Кристална структура GoLoco мотива у комплексу са Г-алфа(и) је решена.[7] Он се састоји од три мала алфа хеликса. Високо очувана Asp-Gln-Arg тријада унутар GoLoco мотива директно учествује у ГДП везивању, путем пружања аргининског бочног ланца у место нуклеотидног везивања. То је слично са каталитичким аргининским прстом који користи активирајући протеин ГТПазе. Овај допринос аргинина у месту везивања утиче на интеракцију ГДП-а са Г-алфа, и стога се важан за ГДИ-активност GoLoco мотива[7].
Примери уреди
Неки од протеина са GoLoco мотивом су:
- Сисарски регулатори Г-протеинске сигнализације 12 и 14 (RGS12 и RGS14).
- Loco, Drosophila melanogaster RGS12 хомолог.
- Сисарски протеин-2 Пуркиње ћелија (Pcp2).
- Еукариотски Rap1GAP. Активатор ГТПазе за нуклеусни рас-сродни регулаторни протеин RAP-1A.
Хумани протеини са овим доменом су:
Литература уреди
- ^ а б Сидеровски ДП, Диверсé-Пиерлуисси M, Де Вриес L (1999). „Тхе ГоЛоцо мотиф: а Галпхаи/о биндинг мотиф анд потентиал гуанине-нуцлеотиде еxцханге фацтор”. Трендс Биоцхем. Сци. 24 (9): 340—1. ПМИД 10470031.
- ^ а б Де Вриес L, Фисцхер Т, Тронцхèре Х, Бротхерс ГМ, Строцкбине Б, Сидеровски ДП, Фарqухар МГ (2000). „Ацтиватор оф Г протеин сигналинг 3 ис а гуанине диссоциатион инхибитор фор Галпха и субунитс”. Проц. Натл. Ацад. Сци. У.С.А. 97 (26): 14364—9. ПМЦ 18924 . ПМИД 11121039. дои:10.1073/пнас.97.26.14364.
- ^ Кимпле РЈ, Кимпле МЕ, Беттс L, Сондек Ј, Сидеровски ДП (2002). „Струцтурал детерминантс фор ГоЛоцо-индуцед инхибитион оф нуцлеотиде релеасе бy Галпха субунитс”. Натуре. 416 (6883): 878—81. ПМИД 11976690. дои:10.1038/416878а.
- ^ „ПДОЦ50132, РГС домаин профиле”.
- ^ Понтинг ЦП (1999). „Раф-лике Рас/Рап-биндинг домаинс ин РГС12- анд стилл-лифе-лике сигналлинг протеинс”. Ј. Мол. Мед. 77 (10): 695—698. ПМИД 10606204. дои:10.1007/с001099900054.
- ^ Артемyев НО, Натоцхин M, Лестер Б, Петерсон YК, Бернард ML, Ланиер СМ (2000). „АГС3 инхибитс ГДП диссоциатион фром галпха субунитс оф тхе Ги фамилy анд рходопсин-депендент ацтиватион оф трансдуцин”. Ј. Биол. Цхем. 275 (52): 40981—40985. ПМИД 11024022. дои:10.1074/јбц.М006478200.
- ^ а б Сидеровски ДП, Кимпле РЈ, Кимпле МЕ, Беттс L, Сондек Ј (2002). „Струцтурал детерминантс фор ГоЛоцо-индуцед инхибитион оф нуцлеотиде релеасе бy Галпха субунитс”. Натуре. 416 (6883): 878—881. ПМИД 11976690. дои:10.1038/416878а.