Entner-Doudorofov put

Entner-Doudorofov put (ED put) opisuje put serije enzimski katalizovanih hemijskih reakcija, koje su aktivne u bakterijskom primarnom metabolizmu. To je put kojim se katabolizuje glukoza do piruvinske kiseline koristeći enzime koji su različiti od onih koji se koriste pri glikolizi ili u putu pentoza fosfata (dva metabolička puta koja su široko zastupljena kod bakterija). ED put su prvi izučavali Majkl Doudorof i Natan Entner sa Bakteriološkog departmana Univerziteta Kalifornije u Berkliju 1952. godine.[1] Nedavni rad na Entner–Duodorofovom putu je pokazao da njegova upotreba nije ograničena na prokariote, kako se ranije mislilo. Specifično, postoji direktna evidencija da Hordeum vulgare koristi Entner-Doudorofov put.[2] Upotreba Entner-Doudorofovog puta među drugim biljkama kao što su mahovine i paprati je isto tako široko raširena sudeći po preliminarnoj analizi podataka sekvenciranja.[2]

Dijagram Entner-Doudorofovog put (KDPG: 2-keto-3-dezoksi-6-fosfoglukonat)

Osobena svojstva Entner-Doudorofovog puta su:

Organizmi koji koriste Entner-Doudorofov putУреди

Postoji nekoliko bakterija koje koriste Entner-Doudorofov put za metabolizam glukoze i koje nemaju sposobnost katabolizma glikolizom (e.g., njima nedostaju esencijalni glikolitički enzimi, poput odsustva fosfofruktokinaze kod roda Pseudomonas).[3] Rodovi u kojima je ovaj put prominentan obuhvataju Gram-negativne bakterije, kao što je navedeno ispod, Gram-pozitivne bakterije, kao što je Enterococcus faecalis,[4] kao i nekoliko Archaea, druge distinktne grane prokariota (i „trećeg domena života, nakon prokariotskih bakterija i eukariota).[5] Većina organizama koji koriste ovaj put je aerobna, usled niskog ATP prinosa po metabolizovanom molekulu glukoze.

Primeri bakterija koje koriste ovaj put su:

Entner-Doudorofov put je prisutan u mnogim vrstama Archaea, čiji metabolizmi „podsećaju ... po [njihovoj] kompleksnosti na one kod bakterija i nižih eukariota”. Ovaj metabolički put je obično obuhvaćen, kao i Embden-Mejerhof-Parnasov put glikolize, ali najčešće kao jedinstvene, modifikovane varijante.[5]

ReferenceУреди

  1. ^ Nathan Entner; Michael Doudoroff (1952). „Glucose and gluconic acid oxidation of Pseudomonas saccharophila (PDF). J. Biol. Chem. 196: 853—862. Приступљено 3. 8. 2015. 
  2. ^ а б в Chen, Xi, et al. "The Entner–Doudoroff pathway is an overlooked glycolytic route in cyanobacteria and plants." Proceedings of the National Academy of Sciences (2016): 201521916.
  3. ^ Conway,T. (1992) "The Entner-Doudorodd pathway: history, physiology and molecular biology" Microbiology of Reviews 103(19; May), pp. 1-28, DOI , see [1]
  4. ^ Willey; Sherwood; Woolverton. Prescott's Principles of Microbiology. 
  5. ^ а б Bräsen C.; D. Esser; B. Rauch & B. Siebers (2014) "Carbohydrate metabolism in Archaea: current insights into unusual enzymes and pathways and their regulation," Microbiol. Mol. Biol. Rev. 78(1; March), pp. 89-175, DOI 10.1128/MMBR.00041-13, see „Archived copy” (PDF). Архивирано из оригинала (PDF) на датум 22. 11. 2015. Приступљено 4. 8. 2015.  or [2], accessed 3 August 2015.
  6. ^ а б Peekhaus N, Conway T (1998). „What's for dinner?: Entner-Doudoroff metabolism in Escherichia coli.”. J Bacteriol. 180 (14): 3495—502. PMC 107313 . PMID 9657988. 
  7. ^ Michael P. Stephenson; Frank A. Jackson; Edwin A. Dawes (1978). „Further Observations on Carbohydrate Metabolism and its Regulation in Azotobacter beijerinckii. Journal of General Microbiology. 109 (1): 89—96. doi:10.1099/00221287. 
  8. ^ Kuykendall, L. David; John M. Young; Esperanza Martínez-Romero; Allen Kerr & Hiroyuka Sawada (2006) Genus I. Rhizobium Frank 1889, 389AL [Order VI. Rhizobiales ord. nov., Family I Rhizobiaceae Conn 1938, 321AL (L. David Kuykendall, Ed.)], pp. 324-339, in Bergey's Manual® of Systematic Bacteriology, Vol. 2 The Proteobacteria, Part 3 The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria, (Don J. Brenner, Noel R. Krieg, James T. Staley, Vol. Eds., George M. Garrity, Ed.-in-Chief), New York, NY, USA: Springer Science & Business, ISBN 0387241450, [3], accessed 3 August 2015.
  9. ^ Arthur LO, Nakamura LK, Julian G, Bulla LA (1975). „Carbohydrate catabolism of selected strains in the genus Agrobacterium.”. Appl Microbiol. 30 (5): 731—7. PMC 187263 . PMID 128316. 
  10. ^ Goddard J.L.; J.R. Sokatch (1964). „2-Ketogluconate fermentation by Streptococcus faecalis.”. J. Bacteriol. 87: 844—851. PMC 277103 . PMID 14137623. 
  11. ^ Lu, G.T.; J.R. Xie; L. Chen; J.R. Hu; S.Q. An; H.Z. Su; et al. (2009). „Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase of Xanthomonas campestris pv. campestris is required for extracellular polysaccharide production and full virulence.”. Microbiology. 155 (5): 1602—1612. PMID 19372163. doi:10.1099/mic.0.023762-0. 

LiteraturaУреди

  • Bräsen C.; D. Esser; B. Rauch & B. Siebers (2014) "Carbohydrate metabolism in Archaea: current insights into unusual enzymes and pathways and their regulation," Microbiol. Mol. Biol. Rev. 78(1; March), pp. 89–175, DOI 10.1128/MMBR.00041-13, see [4] or [5], accessed 3 August 2015.
  • Ahmed, H.; B. Tjaden; R. Hensel & B. Siebers (2004) "Embden–Meyerhof–Parnas and Entner–Doudoroff pathways in Thermoproteus tenax: metabolic parallelism or specific adaptation?," Biochem. Soc. Trans. 32(2; April 1), pp. 303–304, DOI 10.1042/bst0320303, see [6], accessed 3 August 2015.
  • Conway T. (1992) "The Entner-Doudoroff pathway: history, physiology and molecular biology," FEMS Microbiol. Rev., 9(1; September), pp. 1–27, see [7], accessed 3 August 2015.
  • Snyder, L., Peters, J. E., Henkin, T. M., & Champness, W. (2013). Molecular genetics of bacteria. American Society of Microbiology.