Бактериородопсин
Бацтериородопсин је протеин који користе археје, од којих је најпознатија халобацтерија. Он дејствује као протонска пумпа, и.е. апсорбује светлосну енергију и користи је за пренос протона кроз мембрану изван ћелије.[1] Настали протонски градијент се накнадно претвара у хемијску енергију.[2]
Бацтериородопсин је интегрални мембрански протеин који се обично налази у дво-димензионим кристалним мрљама познатим и као "љубичаста мембрана", која може заузети и до скоро 50% површине ћелије археје. Понављајући елемент хексагоналне решетке се састоји од три идентична протеинска ланца, сваки ротиран за 120 степени релативно на друге. Сваки ланац има седам трансмембранских алфа хеликса и садржи један молекул ретинала у себи.[3] То је типична структура за ретинилиденске протеине.
Молекул ретинала мења своју конформацију након апсорпције фотона, што доводи до конформационе промене окружујућег протеина и активности протонске пумпе.[4] Ретинал је ковалентно везан за Lys216 у хромофору дејством Шифове базе. Након фотоизомеризације молекула ретинала, Asp85 постаје прималац протона донираног са молекула ретинала. Ово ослобађа протон из "места држања" на екстрацелуларну страну (ЕЦ) мембране. Репротонација молекула ретинала са Asp96 враћа га у његов првобитни изомерни облик. Последица тога је ослобађање другог протона на ЕЦ страну. Asp85 даје свој протон у "место држања" и нови циклус може да почне.
Молекул бактериородопсина је љубичаст и најефикасније апсорбује зелену светлост (таласна дужина 500-650 nm, са апсорпционим максимумом на 568 nm).
Види још уреди
- Протеин-обложени диск - теоретски капацитет складиштења података од 50 терабајта
Референце уреди
- ^ Доналд Воет; Јудитх Г. Воет (2005). Биоцхемистрy (3 изд.). Wилеy. ИСБН 9780471193500.
- ^ „Бацтериорходопсин: Пумпинг Ионс”.
- ^ Денков НД, Yосхимура Х, Коуyама Т, Wалз Ј, Нагаyама К (1998). „Елецтрон црyомицросцопy оф бацтериорходопсин весицлес: мецханисм оф весицле форматион”. Биопхyсицал Јоурнал. 74 (3): 1409—20. ПМЦ 1299487
. ПМИД 9512037. дои:10.1016/С0006-3495(98)77853-1.
- ^ Хаyасхи С, Тајкхорсхид Е, Сцхултен К (2003). „Молецулар дyнамицс симулатион оф бацтериорходопсин'с пхотоисомеризатион усинг аб инитио форцес фор тхе еxцитед цхромопхоре”. Биопхyсицал Јоурнал. 85 (3): 1440—9. ПМЦ 1303320 . ПМИД 12944261. дои:10.1016/С0006-3495(03)74576-7.
Литература уреди
Спољашње везе уреди
- ПДБ молекул месеца пдб27_1
- UMich оријентација протеина у мембранама фамилиес/суперфамилy-6 - Прорачунате просторне позиције бактериородопсину сличних протеина у мембрани