Интернационални хемијски идентификатор

Интернационални хемијски идентификатор (InChI) је текстуални идентификатор хемијских супстанци. Он је дизајниран да буде стандард кодирања молекулске информације који је једноставан за читање, и истовремено прикладан за претрагу информација у базама података. Развиле су га је организације ИУПАЦ (енгл. International Union of Pure and Applied Chemistry) и НИСТ (енгл. National Institute of Standards and Technology) у току 2000-2005. Формат и алгоритми су незаштићени, и имплементирани су у рачунарским програмима који су слободно доступни под ЛГПЛ лиценцом отвореног кода. Термин InChI је трговинска ознака ИУПАЦ организације.^[1]

Преглед

Ови идентификатори описују хемијске супстанце у виду информационих слојева — атоми и хемијске везе, таутомерска информација, изотопска информација, стерео-хемија, јонизација. Сви слојеви нису увек неопходни, на пример, таутомерски слој се може изоставити кад та је врста информације неважна.

InChI идентификатори се разликује од ЦАС бројева у три погледа:

они су незаштићени,
они се могу формирати на бази хемијске структуре,
највећи део InChI идентификатора се може читати (уз мало праксе).

ИнЦхИ идентификатори се могу сматрати генералном I веома формалном верзијом ИУПАЦ имена. Они могу садржати већи информациони садржај него једноставнија СМИЛЕС нотација. Попут каноничких СМИЛЕС они су јединствени низови знакова, и прикладни су за употребу у базама података. 3Д координате атома нису део InChI формата.

ИнЦхИ алгоритам претвара структурну информацију у јединствени InChI идентификатор у три степена: нормализација (одстрањивање непотребних података), канонизација (стварање јединствене нумеричке етикете атома), и формирање низа знакова.

InChIKey је каширани InChI идентификатор са фиксном дужином од 25 знакова. InChIKey спецификација је објављена у Септембру 2007. године да би се омогућила Веб претраживања хемијских једињења, пошто је то било проблематично користећи InChI.^[2]

Примери

CH₃CH₂OH етанол	`InChI=1/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3`
L-аскорбинска киселина	`InChI=1/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-10H,1H2/t2-,5+/m0/s1`

Види још

Литература

^ МцНаугхт, Алан (2006). „Тхе ИУПАЦ Интернатионал Цхемицал Идентифиер:ИнЦхл”. Цхемистрy Интернатионал. 28 (6). ИУПАЦ.
^ „Тхе ИУПАЦ Интернатионал Цхемицал Идентифиер (ИнЦхИ)”. ИУПАЦ. 5. 9. 2007. Архивирано из оригинала 30. 10. 2007. г.

Спољашње везе

Документација и презентације

ИУПАЦ ИнЦхИ локација
Неслужбена ИнЦхИ ФАQ Архивирано на сајту Wayback Machine (6. март 2012)
ИнЦхИ техничка упутства
Опис алгоритма канонизације
Гооглинг фор ИнЦхИс W3Ц презентација
ИУПАЦ ИнЦхИ Архивирано на сајту Wayback Machine (25. новембар 2011), Гоогле Тецх Талк бy Стеве Хеллер анд Стеве Стеин, 2 Новембер 2006

Софтвер и услуге

НЦИ/ЦАДД Цхемицал Идентифиер Ресолвер, Генерише и претвара InChI/InChIKeys и многе друге хемијске идентификаторе
Генерате ИнЦхИ, Интерактивна служба на Универзитету Кембриџа
Сеарцх Гоогле фор молецулес, Генерише InChI из интерактивно нацртаних молекула, и претражује Гоогле. Јавасцрипт оспособљен Веб претраживач је потребан
ЦхемСкетцх Архивирано на сајту Wayback Machine (18. октобар 2006), Бесплатан програм за цртање хемијских структура са улазом и излазом у InCHI формату
ПубЦхем
ЦхемСпидер Сервицес
МарвинСкетцх ЦхемАxон
БКцхем Архивирано на сајту Wayback Machine (9. јун 2007)

[McNaught2006-1] МцНаугхт, Алан (2006). „Тхе ИУПАЦ Интернатионал Цхемицал Идентифиер:ИнЦхл”. Цхемистрy Интернатионал. 28 (6). ИУПАЦ.

[IUPACInChIKey-2] „Тхе ИУПАЦ Интернатионал Цхемицал Идентифиер (ИнЦхИ)”. ИУПАЦ. 5. 9. 2007. Архивирано из оригинала 30. 10. 2007. г.

[1]

[2]