Плекстрински хомологни домен
Плекстрински хомологни домен (ПХ домен) је протеински домен са приближно 120 аминокиселина. Он се јавља у широком опсегу протеина који учествују у интраћелијској сигнализацији или су конституенти цитоскелетона.[1][2][3][4][5][6][7]
 ПХ домен тирозинске протеинске киназе БТК | |||||||||
| Идентификатори | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Симбол | PH | ||||||||
| Пфам | ПФ00169 | ||||||||
| ИнтерПро | ИПР001849 | ||||||||
| СМАРТ | ПХ | ||||||||
| ПРОСИТЕ | ПДОЦ50003 | ||||||||
| СЦОП | 1дyн | ||||||||
| СУПЕРФАМИЛY | 1дyн | ||||||||
| ОПМ суперфамилија | 51 | ||||||||
| ОПМ протеин | 1плс | ||||||||
| ЦДД | цд00821 | ||||||||
| |||||||||
Овај домен је присутан у фосфатидилинозитолним липидима унутар биолошких мембрана (као што је фосфатидилинозитол (3,4,5)-трисфосфат и фосфатидилинозитол (4,5)-бисфосфат),[8] и протеинима попут βγ-подјединица хетеротримерних Г протеина,[9] и протеинске киназе C.[10] Путем тих интеракција, ПХ домени учествују у регруитовању протеина у различите мембране, те их сортирају у одговарајуће ћелијске компартмане или им омогућавају да формирају интеракције са другим компонентама путева преноса сигнала.
Потфамилије уреди
Примери уреди
Следећи гени кодирају протеине са PH доменом:
- АБР, АДРБК1, АДРБК2, АФАП, АФАП1, АФАП1Л1, АФАП1Л2, АКАП13, АКТ1, АКТ2, АКТ3, АНЛН, АПББ1ИП, АППЛ1, АППЛ2, АРХГАП10, АРХГАП12, АРХГАП15, АРХГАП21, АРХГАП22, АРХГАП23, АРХГАП24, АРХГАП25, АРХГАП26, АРХГАП27, АРХГАП9, АРХГЕФ16, АРХГЕФ18, АРХГЕФ19, АРХГЕФ2, АРХГЕФ3, АРХГЕФ4, АРХГЕФ5, АРХГЕФ6, АРХГЕФ7, АРХГЕФ9, АСЕФ2,
- БМX, БТК,
- Ц20орф42, Ц9орф100, ЦАДПС, ЦАДПС2, ЦДЦ42БПА, ЦДЦ42БПБ, ЦДЦ42БПГ, ЦЕНТА1, ЦЕНТА2, ЦЕНТБ1, ЦЕНТБ2, ЦЕНТБ5, ЦЕНТД1, ЦЕНТД2, ЦЕНТД3, ЦЕНТГ1, ЦЕНТГ2, ЦЕНТГ3, ЦИТ, ЦНКСР1, ЦНКСР2, ЦОЛ4А3БП, ЦТГЛФ1, ЦТГЛФ2, ЦТГЛФ3, * ЦТГЛФ4, ЦТГЛФ5, ЦТГЛФ6,
- ДАБ2ИП, ДАПП1, ДДЕФ1, ДДЕФ2, ДДЕФЛ1, ДЕФ6, ДЕПДЦ2, ДГКД, ДГКХ, ДГКК, ДНМ1, ДНМ2, ДНМ3, ДОЦК10, ДОЦК11, ДОЦК9, ДОК1, ДОК2, ДОК3, ДОК4, ДОК5, ДОК6, ДТГЦУ2,
- ЕXОЦ8,
- ФАМ109А, ФАМ109Б, ФАРП1, ФАРП2, ФГД1, ФГД2, ФГД3, ФГД4, ФГД5, ФГД6,
- ГАБ1, ГАБ2, ГАБ3, ГАБ4, ГРБ10, ГРБ14, ГРБ7,
- ИРС1, ИРС2, ИРС4, ИТК, ИТСН1, ИТСН2,
- КАЛРН, КИФ1А, КИФ1Б, КИФ1Ббета,
- МЦФ2, МЦФ2Л, МЦФ2Л2, МРИП, МYО10,
- НЕТ1, НГЕФ,
- ОБПХ1, ОБСЦН, ОПХН1, ОСБП, ОСБП2, ОСБПЛ10, ОСБПЛ11, ОСБПЛ3, ОСБПЛ5, ОСБПЛ6, ОСБПЛ7, ОСБПЛ8, ОСБПЛ9,
- ПХЛДА2, ПХЛДА3, ПХЛДБ1, ПХЛДБ2, ПХЛПП, ПИП3-Е, ПЛЦД1, ПЛЦД4, ПЛЦГ1, ПЛЦГ2, ПЛЦХ1, ПЛЦХ2, ПЛЦЛ1, ПЛЦЛ2, ПЛД1, ПЛД2, ПЛЕК, ПЛЕК2, ПЛЕКХА1, ПЛЕКХА2, ПЛЕКХА3, ПЛЕКХА4, ПЛЕКХА5, ПЛЕКХА6, ПЛЕКХА7, ПЛЕКХА8, ПЛЕКХБ1, ПЛЕКХБ2, ПЛЕКХЦ1, ПЛЕКХФ1, ПЛЕКХФ2, ПЛЕКХГ1, ПЛЕКХГ2, ПЛЕКХГ3, ПЛЕКХГ4, ПЛЕКХГ5, ПЛЕКХГ6, ПЛЕКХХ1, ПЛЕКХХ2, ПЛЕКХХ3, ПЛЕКХЈ1, ПЛЕКХК1, ПЛЕКХМ1, ПЛЕКХМ2, ПЛЕКХО1, ПЛЕКХQ1, ПРЕX1, ПРКЦН, ПРКД1, ПРКД2, ПРКД3, ПСЦД1, ПСЦД2, ПСЦД3, ПСЦД4, ПСД, ПСД2, ПСД3, ПСД4, РАЛГПС1, РАЛГПС2, РАПХ1,
- РАСА1, РАСА2, РАСА3, РАСА4, РАСАЛ1, РАСГРФ1, РГНЕФ, РОЦК1, РОЦК2, РТКН,
- СБФ1, СБФ2, СЦАП2, СГЕФ, СХ2Б, СХ2Б1, СХ2Б2, СХ2Б3, СХ3БП2, СКАП1, СКАП2, СНТА1, СНТБ1, СНТБ2, СОС1, СОС2, СПАТА13, СПНБ4, СПТБН1, СПТБН2, СПТБН4, СПТБН5, СТАП1, СWАП70, СYНГАП1,
- ТБЦ1Д2, ТЕЦ, ТИАМ1, ТРИО, ТРИОБП, ТYЛ,
- УРП1, УРП2,
- ВАВ1, ВАВ2, ВАВ3, ВЕПХ1
Референце уреди
- ^ Маyер БЈ, Рен Р, Цларк КЛ, Балтиморе D (1993). „А путативе модулар домаин пресент ин диверсе сигналинг протеинс”. Целл. 73 (4): 629—30. ПМИД 8500161. дои:10.1016/0092-8674(93)90244-К.
- ^ Хаслам РЈ, Коиде ХБ, Хеммингс БА (1993). „Плецкстрин домаин хомологy”. Натуре. 363 (6427): 309—10. ПМИД 8497315. дои:10.1038/363309б0.
- ^ Мусаццхио А, Гибсон Т, Рице П, Тхомпсон Ј, Сарасте M (1993). „Тхе ПХ домаин: а цоммон пиеце ин тхе струцтурал патцхwорк оф сигналлинг протеинс”. Трендс Биоцхем. Сци. 18 (9): 343—8. ПМИД 8236453. дои:10.1016/0968-0004(93)90071-Т.
- ^ Гибсон ТЈ, Хyвöнен M, Мусаццхио А, Сарасте M, Бирнеy Е (1994). „ПХ домаин: тхе фирст анниверсарy”. Трендс Биоцхем. Сци. 19 (9): 349—53. ПМИД 7985225. дои:10.1016/0968-0004(94)90108-2.
- ^ Паwсон Т (1995). „Протеин модулес анд сигналлинг нетwоркс”. Натуре. 373 (6515): 573—80. ПМИД 7531822. дои:10.1038/373573а0.
- ^ Инглеy Е, Хеммингс БА (1994). „Плецкстрин хомологy (ПХ) домаинс ин сигнал трансдуцтион”. Ј. Целл. Биоцхем. 56 (4): 436—43. ПМИД 7890802. дои:10.1002/јцб.240560403.
- ^ Сарасте M, Хyвöнен M (1995). „Плецкстрин хомологy домаинс: а фацт филе”. Цурр. Опин. Струцт. Биол. 5 (3): 403—8. ПМИД 7583640. дои:10.1016/0959-440X(95)80104-9.
- ^ Wанг ДС, Схаw Г (1995). „Тхе ассоциатион оф тхе C-терминал регион оф бета I сигма II спецтрин то браин мембранес ис медиатед бy а ПХ домаин, доес нот реqуире мембране протеинс, анд цоинцидес wитх а иноситол-1,4,5 трипхоспхате биндинг сите”. Биоцхем. Биопхyс. Рес. Цоммун. 217 (2): 608—15. ПМИД 7503742. дои:10.1006/ббрц.1995.2818.
- ^ Wанг ДС, Схаw Р, Wинкелманн ЈЦ, Схаw Г (1994). „Биндинг оф ПХ домаинс оф бета-адренергиц рецептор кинасе анд бета-спецтрин то WД40/бета-трансдуцин репеат цонтаининг регионс оф тхе бета-субунит оф тримериц Г-протеинс”. Биоцхем. Биопхyс. Рес. Цоммун. 203 (1): 29—35. ПМИД 8074669. дои:10.1006/ббрц.1994.2144.
- ^ Yао L, Каwаками Y, Каwаками Т (1994). „Тхе плецкстрин хомологy домаин оф Брутон тyросине кинасе интерацтс wитх протеин кинасе Ц”. Проц. Натл. Ацад. Сци. У.С.А. 91 (19): 9175—9. ПМЦ 44770
. ПМИД 7522330. дои:10.1073/пнас.91.19.9175.
Види још уреди
Спољашње везе уреди
- Nash Lab Protein Interaction Domains - PH domain description[мртва веза]
- UMich оријентација протеина у мембранама фамилиес/суперфамилy-51 - Calculated orientations of PH domains in membranes