Понављање богато леуцином
Понављање богато леуцином (LRR) је протеински структурни мотив који формира структуру α/β потковице.[1][2] Он се састоји од понављања која су 20–30 аминокиселина дуга, и која су обично богата у хидрофобној аминокиселини леуцину. Типично, свака јединица понављања има бета ланац-окрет-алфа хеликс структуру. Домен формиран од многих таквих понављања има облик потковице са унутрашњом паралелном бета равни и спољашњим низом хеликса. Једно лице бета равни и једна страна низа хеликса су изложени растварачу и стога су богати у хидрофилним остацима. Регион између хеликса и равни је протеинска хидрофобна основа и чврсто је стерично пакована леуцинским остацима.
 Пример протеина са понављањем богатим леуцином, свињски инхибитор рибонуклеазе | |||||||||
| Идентификатори | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Симбол | ЛРР_1 | ||||||||
| Пфам | ПФ00560 | ||||||||
| Пфам клан | ЦЛ0022 | ||||||||
| ИнтерПро | ИПР001611 | ||||||||
| СЦОП | 2бнх | ||||||||
| СУПЕРФАМИЛY | 2бнх | ||||||||
| ОПМ протеин | 1xwд | ||||||||
| |||||||||
| Варијанта понављања богатог леуцином | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Варијанта понављања богатог леуцином | |||||||||
| Идентификатори | |||||||||
| Симбол | ЛРВ | ||||||||
| Пфам | ПФ01816 | ||||||||
| Пфам клан | ЦЛ0020 | ||||||||
| ИнтерПро | ИПР004830 | ||||||||
| СЦОП | 1лрв | ||||||||
| СУПЕРФАМИЛY | 1лрв | ||||||||
| |||||||||
Понављања богато леуцином често учествују у формирању међупротеинских интеракција.[3][4]
Види још уреди
Референце уреди
- ^ Кобе Б, Деисенхофер Ј (1994). „Тхе леуцине-рицх репеат: а версатиле биндинг мотиф”. Трендс Биоцхем. Сци. 19 (10): 415—21. ПМИД 7817399. дои:10.1016/0968-0004(94)90090-6.
- ^ Енкхбаyар П, Камиyа M, Осаки M, Матсумото Т, Матсусхима Н (2004). „Струцтурал принциплес оф леуцине-рицх репеат (ЛРР) протеинс”. Протеинс. 54 (3): 394—403. ПМИД 14747988. дои:10.1002/прот.10605.
- ^ Кобе Б, Кајава АВ (2001). „Тхе леуцине-рицх репеат ас а протеин рецогнитион мотиф”. Цурр. Опин. Струцт. Биол. 11 (6): 725—32. ПМИД 11751054. дои:10.1016/С0959-440X(01)00266-4.
- ^ Гаy Њ, Пацкман ЛЦ, Wелдон МА, Барна ЈЦ (1991). „А леуцине-рицх репеат пептиде деривед фром тхе Дросопхила Толл рецептор формс еxтендед филаментс wитх а бета-схеет струцтуре”. ФЕБС Летт. 291 (1): 87—91. ПМИД 1657640. дои:10.1016/0014-5793(91)81110-Т.
Литература уреди
- Тоозе, Јохн; Брäндéн, Царл-Ивар (1999). Интродуцтион то Протеин Струцтуре (2нд изд.). Неw Yорк: Гарланд Публисхинг.
- Wеи Т, Гонг Ј, Јамитзкy Ф, Хецкл WМ, Старк РW, Роессле СЦ (2008). „ЛРРМЛ: а цонформатионал датабасе анд ан XМЛ десцриптион оф леуцине-рицх репеатс (ЛРРс)”. БМЦ Струцт. Биол. 8 (1): 47. ПМЦ 2645405
. ПМИД 18986514. дои:10.1186/1472-6807-8-47.
Спољашње везе уреди
- SCOP LRR fold
- CATH Alpha-beta horseshoe architecture
- LRRML: a conformational database of leucine-rich repeats
- Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR012569
- Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR013210
- Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR000372
- Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR000483
- Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR004830
- Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR004830