Ponavljanje bogato leucinom

Ponavljanje bogato leucinom (LRR) je proteinski strukturni motiv koji formira strukturu α/β potkovice.[1][2] On se sastoji od ponavljanja koja su 20–30 aminokiselina duga, i koja su obično bogata u hidrofobnoj aminokiselini leucinu. Tipično, svaka jedinica ponavljanja ima beta lanac-okret-alfa heliks strukturu. Domen formiran od mnogih takvih ponavljanja ima oblik potkovice sa unutrašnjom paralelnom beta ravni i spoljašnjim nizom heliksa. Jedno lice beta ravni i jedna strana niza heliksa su izloženi rastvaraču i stoga su bogati u hidrofilnim ostacima. Region između heliksa i ravni je proteinska hidrofobna osnova i čvrsto je sterično pakovana leucinskim ostacima.

Primer proteina sa ponavljanjem bogatim leucinom, svinjski inhibitor ribonukleaze
Identifikatori
SimbolLRR_1
PfamPF00560
Pfam klanCL0022
InterProIPR001611
SCOP2bnh
SUPERFAMILY2bnh
OPM protein1xwd
Varijanta ponavljanja bogatog leucinom
Varijanta ponavljanja bogatog leucinom
Identifikatori
SimbolLRV
PfamPF01816
Pfam klanCL0020
InterProIPR004830
SCOP1lrv
SUPERFAMILY1lrv

Ponavljanja bogato leucinom često učestvuju u formiranju međuproteinskih interakcija.[3][4]

Vidi još

uredi

Reference

uredi
  1. ^ Kobe B, Deisenhofer J (1994). „The leucine-rich repeat: a versatile binding motif”. Trends Biochem. Sci. 19 (10): 415—21. PMID 7817399. doi:10.1016/0968-0004(94)90090-6. 
  2. ^ Enkhbayar P, Kamiya M, Osaki M, Matsumoto T, Matsushima N (2004). „Structural principles of leucine-rich repeat (LRR) proteins”. Proteins. 54 (3): 394—403. PMID 14747988. doi:10.1002/prot.10605. 
  3. ^ Kobe B, Kajava AV (2001). „The leucine-rich repeat as a protein recognition motif”. Curr. Opin. Struct. Biol. 11 (6): 725—32. PMID 11751054. doi:10.1016/S0959-440X(01)00266-4. 
  4. ^ Gay NJ, Packman LC, Weldon MA, Barna JC (1991). „A leucine-rich repeat peptide derived from the Drosophila Toll receptor forms extended filaments with a beta-sheet structure”. FEBS Lett. 291 (1): 87—91. PMID 1657640. doi:10.1016/0014-5793(91)81110-T. 

Literatura

uredi

Spoljašnje veze

uredi