Отворите главни мени
λ represor bakteriofaga lambda koristi heliks-zavoj-heliks (levo; zeleno) da se veže za DNK (desno; plavo i crveno).

U proteinima, heliks-zavoj-heliks (HTH) je glavni strukturni motiv sa sposobnošću vezivanja za DNK. On se sastoji od dva α heliksa spojena kratkim lancom aminokiselina. Prisutan je u mnogim proteinima koji regulišu ekspresiju gena. On se razlikuje od domena heliks-petlja-heliks.[1]

OtkrićeУреди

Otkriće heliks-zavoj-heliks motiva je bilo bazirano na sličnostima između nekoliko gena koji koriraju transkripcione regulatorne proteine iz bakteriofaga lambda i Escherichia coli: Cro, CAP, i λ represor, za koje je najđeno da imaju zajedničku 20-25 aminokiselina dugu sekvencu koja omogućava DNK prepoznavanje.[2][3][4][5]

ReferenceУреди

  1. ^ Brennan RG, Matthews BW (1989). „The helix-turn-helix DNA binding motif.”. J Biol Chem. 264 (4): 1903—6. PMID 2644244. 
  2. ^ Matthews BW, Ohlendorf DH, Anderson WF, Takeda Y (1982). „Structure of the DNA-binding region of lac repressor inferred from its homology with cro repressor.”. Proc Natl Acad Sci U S A. 79 (5): 1428—32. PMC 345986 . PMID 6951187. 
  3. ^ Anderson WF, Ohlendorf DH, Takeda Y, Matthews BW (1981). „Structure of the cro repressor from bacteriophage lambda and its interaction with DNA.”. Nature. 290 (5809): 754—8. PMID 6452580. 
  4. ^ McKay DB, Steitz TA (1981). „Structure of catabolite gene activator protein at 2.9 A resolution suggests binding to left-handed B-DNA.”. Nature. 290 (5809): 744—9. PMID 6261152. 
  5. ^ Pabo CO, Lewis M (1982). „The operator-binding domain of lambda repressor: structure and DNA recognition.”. Nature. 298 (5873): 443—7. PMID 7088190. 

LiteraturaУреди

Vidi jošУреди

Spoljašnje vezeУреди

Heliks-zavoj-heliks domeni
Bakterijski regulatorni heliks-zavoj-heliks protein, lysR familija
Identifikatori
SimbolHTH_1
PfamPF00126
Pfam klanCL0123
InterProIPR000847
PROSITEPDOC00043
SCOP1al3
SUPERFAMILY1al3
HTH DNA vezujući domen
Identifikatori
SimbolHTH_10
PfamPF04967
Pfam klanCL0123
InterProIPR007050
Ribonukleazni R heliksni domen
Identifikatori
SimbolHTH_12
PfamPF08461
Pfam klanCL0123
InterProIPR013668
HTH DNA vezujući domen
Identifikatori
SimbolHTH_13
PfamPF11972
Pfam klanCL0123
InterProIPR021068
Heliks-zavoj-heliks
Identifikatori
SimbolHTH_3
PfamPF01381
Pfam klanCL0123
InterProIPR001387
SCOP1r69
SUPERFAMILY1r69
Bakterijski regulatorni protein, arsR familija
Identifikatori
SimbolHTH_5
PfamPF01022
Pfam klanCL0123
InterProIPR001845
PROSITEPDOC00661
SCOP1smt
SUPERFAMILY1smt
Heliks-zavoj-heliks domen, rpiR familija
Identifikatori
SimbolHTH_6
PfamPF01418
Pfam klanCL0123
InterProIPR000281
Heliks-zavoj-heliks domen rezolvaze
Identifikatori
SimbolHTH_7
PfamPF02796
Pfam klanCL0123
InterProIPR006120
PROSITEPDOC00334
SCOP1hcr
SUPERFAMILY1hcr
Bakterijski regulatorni protein, Fis familija
Identifikatori
SimbolHTH_8
PfamPF02954
Pfam klanCL0123
InterProIPR002197
SCOP1f36
SUPERFAMILY1f36
RNA polimeraza III podjedinica RPC82 heliks-zavoj-heliks domen
Identifikatori
SimbolHTH_9
PfamPF08221
Pfam klanCL0123
InterProIPR013197
Bakterijski regulatorni heliks-zavoj-heliks proteini, AraC familija
Identifikatori
SimbolHTH_AraC
PfamPF00165
Pfam klanCL0123
InterProIPR000005
PROSITEPDOC00040
SCOP1bl0
SUPERFAMILY1bl0
CodY heliks-zavoj-heliks domen
Identifikatori
SimbolHTH_CodY
PfamPF08222
Pfam klanCL0123
InterProIPR013198
DeoR sličan heliks-zavoj-heliks domen
Identifikatori
SimbolHTH_DeoR
PfamPF08220
Pfam klanCL0123
InterProIPR001034
PROSITEPDOC00696
SCOP1lk5
SUPERFAMILY1lk5
IclR heliks-zavoj-heliks domen
Identifikatori
SimbolHTH_IclR
PfamPF09339
Pfam klanCL0123
InterProIPR005471
M protein trans delujući pozitivni regulator (MGA) HTH domen
Identifikatori
SimbolHTH_Mga
PfamPF08280
Pfam klanCL0123
InterProIPR013199
Heliks-zavoj-heliks domen
Identifikatori
SimbolHTH_OrfB_IS605
PfamPF12323
Pfam klanCL0123
InterProIPR021027
Heliks-zavoj-heliks Psq domen
Identifikatori
SimbolHTH_psq
PfamPF05225
Pfam klanCL0123
InterProIPR007889
Transposaza
Identifikatori
SimbolHTH_Tnp_1
PfamPF01527
Pfam klanCL0123
InterProIPR002514
Transposaza
Identifikatori
SimbolHTH_Tnp_IS630
PfamPF01710
Pfam klanCL0123
InterProIPR002622
Mi DNK vezujući domen
Identifikatori
SimbolHTH_Tnp_Mu_1
PfamPF02316
Pfam klanCL0123
InterProIPR003314
SCOP1qpm
SUPERFAMILY1qpm
Mi DNK Vezujući, I gama poddomen
Identifikatori
SimbolHTH_Tnp_Mu_2
PfamPF09039
Pfam klanCL0123
InterProIPR015126
Transposaza
Identifikatori
SimbolHTH_Tnp_Tc3_2
PfamPF01498
Pfam klanCL0123
InterProIPR002492
SCOP1tc3
SUPERFAMILY1tc3
Tc5 transposaza DNA vezujući domen
Identifikatori
SimbolHTH_Tnp_Tc5
PfamPF03221
Pfam klanCL0123
InterProIPR004906
Regulator sporulacije, WhiA C terminusni domen
Identifikatori
SimbolHTH_WhiA
PfamPF02650
Pfam klanCL0123
InterProIPR003802
Heliks-zavoj-heliks domen alkil merkuri liaze
Identifikatori
SimbolHTH_15
PfamPF12324
Pfam klanCL0123
Heliks-zavoj-heliks domen
Identifikatori
SimbolHTH_16
PfamPF12645
Pfam klanCL0123
Heliks-zavoj-heliks domen
Identifikatori
SimbolHTH_17
PfamPF12728
Pfam klanCL0123
Heliks-zavoj-heliks domen
Identifikatori
SimbolHTH_18
PfamPF12833
Pfam klanCL0123
Heliks-zavoj-heliks domen
Identifikatori
SimbolHTH_19
PfamPF12844
Pfam klanCL0123
Heliks-zavoj-heliks domen
Identifikatori
SimbolHTH_20
PfamPF12840
Pfam klanCL0123
InsA C-terminusni domen
Identifikatori
SimbolHTH_Tnp_IS1
PfamPF12759
Pfam klanCL0123
Heliks-zavoj-heliks domen transposaze IS66
Identifikatori
SimbolHTH_Tnp_IS66
PfamPF13005
Pfam klanCL0123
HTH domen
Identifikatori
SimbolHTH_11
PfamPF08279
Pfam klanCL0123
InterProIPR013196
Tc3 transposaza
Identifikatori
SimbolHTH_Tnp_Tc3_1
PfamPF11427
Pfam klanCL0123