Деамидација
Деамидација је хемијска реакција у којој се амидна функционална група одстрањује из органског једињења. У биохемији је ова реакција важна у деградацији протеина, јер оштећује бочне ланце који садрже амиде, аспарагин и глутамин.
У биохемијској реакцији деамидације, бочни ланац аспарагина напада суседну пептидну групу формирајући симетрични сукцинимидни интермедијер. Симетрија интермедијера резултује у два продукта хидролизе, било аспартат или изоаспартат, који је бета аминокиселина. Овај процес се сматра деамидацијом јер се амид аспарагинског бочног ланца замењује карбоксилатном групом. Слична реакција се може јавити са аспартатним бочним ланцом, производећи парцијалну конверзију до изоаспартата.
Литература уреди
- Clarke S. (1987) "Propensity for spontaneous succinimide formation from aspartyl and asparaginyl residues in cellular proteins", Int. J., Peptide Protein Res., Clarke, S. (1987). „Propensity for spontaneous succinimide formation from aspartyl and asparaginyl residues in cellular proteins”. International Journal of Peptide and Protein Research. 30 (6): 808—821. PMID 3440704. doi:10.1111/j.1399-3011.1987.tb03390.x., 808-821.
- Stephenson RC and Clarke S. (1989) "Succinimide Formation from Aspartyl and Asparaginyl Peptides as a Model for the Spontaneous Degradation of Proteins", J. Biol. Chem., Stephenson, R. C.; Clarke, S. (1989). „Succinimide formation from aspartyl and asparaginyl peptides as a model for the spontaneous degradation of proteins”. The Journal of Biological Chemistry. 264 (11): 6164—6170. PMID 2703484. doi:10.1016/S0021-9258(18)83327-0
., 6164-6170. - Robinson NE, Robinson AB. Molecular Clocks: Deamidation of Asparaginyl and Glutaminyl Residues in Peptides and Proteins. Althouse Press: Cave Junction, Ore.
