Имуноглобулинска суперфамилија
Имуноглобулинска суперфамилија (IgSF) је велика група мембранских и растворних протеина, која учествује у препознавању, везивању, или адхезионим процесима ћелија. Молекули су груписани у ову суперфамилију на основу заједничких структурних својстава са имуноглобулинима (такође познатим као антитела). Сви они поседују домен познат као имуноглобулински домен или савијање. Чланови IgSF су антигенски рецептори са ћелијске површине, корецепторски и костимулаторни молекули имунског система, молекули који учествују у презентацији антигена на лимфоцитима, ћелијски адхезивни молекули, поједини цитокински рецептори и интрацелуларни мишићни протеини. Они се често део имунског система.
| Имуноглобулинска суперфамилија | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Антитело у комплексу са лизозимом беланца кокошијег јајета.[1] | |||||||||
| Идентификатори | |||||||||
| Симбол | ИгСФ | ||||||||
| Пфам | ПФ00047 | ||||||||
| Пфам клан | ЦЛ0011 | ||||||||
| ИнтерПро | ИПР013151 | ||||||||
| ПРОСИТЕ | ПС50835 | ||||||||
| СЦОП | 1тлк | ||||||||
| СУПЕРФАМИЛY | 1тлк | ||||||||
| ОПМ суперфамилија | 230 | ||||||||
| ОПМ протеин | 3биб | ||||||||
| ЦДД | цд00096 | ||||||||
| |||||||||
Имуноглобулински домени
уредиПротеини имуноглобулинска суперфамилије поседују структурни домен познат као имуноглобулин (Ig) домен. Ig домени су добили име по молекулу имуноглобулина. Они садрже око 70-110 аминокиселина и групишу се на основу њихове величине и функције.[2] Иг-домени поседују карактеристично имуноглобулинско савијање, које има структуру сличну сендвићу формирану од две равни са антипаралним бета ланцима. Интеракције између хидрофобних аминокиселина унутрашње стране сендвича и високо конзервиране дисулфидне везе формиране између цистеина у Б и Ф ланцима, стабилизују Иг-савијање. Један крај Иг домена има секцију која се назива регион одређивања комплементарности који је важан за специфицифичност антитела за њихове лиганде.
Класификација
уредиДомени који су слични са Ig се могу класификовати као IgV, IgC1, IgC2, или IgI.[3]
Већина Ig домена су било променљиви (IgV) или константни (IgC).
- IgV: IgV домени са 9 бета ланаца су генерално дужи од IgC домена са 7 бета ланаца.
- IgC1 и IgC2: Ig домени неких IgSF чланова подсећају на IgV домене по аминокиселинским секвенцама, мада имају сличну величину са IgC доменима. Они се називају IgC2 доменима, док се стандардни IgC домени називају IgC1 доменима.
- IgI: Други Ig домени који се називају интермедијерни (I) домени.[4]
Референце
уреди- ^ Далл'Ацqуа W; Голдман ЕР; Лин W; et al. (1998). „А мутатионал аналyсис оф биндинг интерацтионс ин ан антиген-антибодy протеин-протеин цомплеx”. Биоцхемистрy. 37 (22): 7981—91. ПМИД 9609690. дои:10.1021/би980148ј.
- ^ Барцлаy А (2003). „Мембране протеинс wитх иммуноглобулин-лике домаинс--а мастер суперфамилy оф интерацтион молецулес”. Семин Иммунол. 15 (4): 215—23. ПМИД 14690046. дои:10.1016/С1044-5323(03)00047-2.
- ^ Б. D. Гомпертс; Крамер, Ијсбранд M.; Петер Е. Р. Татхам (2009). Сигнал трансдуцтион. Ацадемиц Пресс. стр. 378—. ИСБН 978-0-12-369441-6. Приступљено 28. 11. 2010.
- ^ Харпаз Y, Цхотхиа C (1994). „Манy оф тхе иммуноглобулин суперфамилy домаинс ин целл адхесион молецулес анд сурфаце рецепторс белонг то а неw струцтурал сет wхицх ис цлосе то тхат цонтаининг вариабле домаинс”. Ј. Мол. Биол. 238 (4): 528—39. ПМИД 8176743. дои:10.1006/јмби.1994.1312.