Пропидијум јодид
Пропидијум јодид (или ПИ) је флуоресцентан интеркалирајући агенс који се користи за бојење ћелија. Пропидијум јодиде се користи као ДНК боја у проточној цитометрији за евалуацију ћелијске одрживости или одређивање ДНК садржаја у анализи ћелијског циклуса,[3] или у микроскопији за визуализацију нуклеуса или других органела које садрже ДНК. Пропидијум јодид не може да прође кроз мембрану живих ћелија, што га чини корисним у прављењу разлике између некротичних, апоптотичних и здравих ћелија.[4][5] ПИ се исто тако везује за РНК, из ког разлога је неопхода третман нуклеазама да би разликовало РНК од ДНК бојења.[6]
![]() | |
Идентификација | |
---|---|
3Д модел (Jmol)
|
|
ChEBI | |
ChemSpider | |
ECHA InfoCard | 100.042.786 |
| |
Својства | |
C27H34I2N4 | |
Моларна маса | 668,395 |
Уколико није другачије напоменуто, подаци се односе на стандардно стање материјала (на 25 °C [77 °F], 100 kPa). | |
Референце инфокутије | |
Особине
уредиПропидијум јодид је органско једињење, које садржи 27 атома угљеника и има молекулску масу од 668,395 Da.
Osobina | Vrednost |
---|---|
Broj akceptora vodonika | 3 |
Broj donora vodonika | 2 |
Broj rotacionih veza | 7 |
Particioni koeficijent[7] (ALogP) | -1,1 |
Растворљивост[8] (logS, log(mol/L)) | -3,8 |
Поларна површина[9] (PSA, Å2) | 102,4 |
Референце
уреди- ^ Li Q, Cheng T, Wang Y, Bryant SH (2010). „PubChem as a public resource for drug discovery.”. Drug Discov Today. 15 (23-24): 1052—7. PMID 20970519. doi:10.1016/j.drudis.2010.10.003.
- ^ Evan E. Bolton; Yanli Wang; Paul A. Thiessen; Stephen H. Bryant (2008). „Chapter 12 PubChem: Integrated Platform of Small Molecules and Biological Activities”. Annual Reports in Computational Chemistry. 4: 217—241. doi:10.1016/S1574-1400(08)00012-1.
- ^ „Propidium Iodide Solution - BioLegend”. Архивирано из оригинала 10. 02. 2015. г. Приступљено 10. 1. 2015.
- ^ Lecoeur H (2002). „Nuclear apoptosis detection by flow cytometry: influence of endogenous endonucleases”. Exp. Cell Res. 277 (1): 1—14. PMID 12061813. doi:10.1006/excr.2002.5537.
- ^ „Propidium Iodide”. ThermoFisher.
- ^ Suzuki T, Fujikura K, Higashiyama T, Takata K (1. 1. 1997). „DNA staining for fluorescence and laser confocal microscopy”. J. Histochem. Cytochem. 45 (1): 49—53. PMID 9010468. doi:10.1177/002215549704500107.[мртва веза]
- ^ Ghose, A.K.; Viswanadhan V.N. & Wendoloski, J.J. (1998). „Prediction of Hydrophobic (Lipophilic) Properties of Small Organic Molecules Using Fragment Methods: An Analysis of AlogP and CLogP Methods”. J. Phys. Chem. A. 102: 3762—3772. doi:10.1021/jp980230o.
- ^ Tetko IV, Tanchuk VY, Kasheva TN, Villa AE (2001). „Estimation of Aqueous Solubility of Chemical Compounds Using E-State Indices”. Chem Inf. Comput. Sci. 41: 1488—1493. PMID 11749573. doi:10.1021/ci000392t.
- ^ Ertl P.; Rohde B.; Selzer P. (2000). „Fast calculation of molecular polar surface area as a sum of fragment based contributions and its application to the prediction of drug transport properties”. J. Med. Chem. 43: 3714—3717. PMID 11020286. doi:10.1021/jm000942e.
Литература
уреди- Цлаyден, Јонатхан; Греевес, Ницк; Wаррен, Стуарт; Wотхерс, Петер (2001). Органиц Цхемистрy (I изд.). Оxфорд Университy Пресс. ИСБН 978-0-19-850346-0.
- Смитх, Мицхаел Б.; Марцх, Јеррy (2007). Адванцед Органиц Цхемистрy: Реацтионс, Мецханисмс, анд Струцтуре (6тх изд.). Неw Yорк: Wилеy-Интерсциенце. ИСБН 0-471-72091-7.
- Катритзкy А.Р.; Позхарскии А.Ф. (2000). Хандбоок оф Хетероцyцлиц Цхемистрy (Сецонд изд.). Ацадемиц Пресс. ИСБН 0080429882.