Peptidaza Do (EC 3.4.21.107, DegP, DegP proteaza, HtrA, proteaza A sa zahtevom za visoku temperaturu, HrtA protein toplotnog šoka, proteaza Do, Do proteaza) je enzim.[1][2][3][4][5][6] Ovaj enzim katalizuje sledeću hemijsku reakciju

Peptidaza Do
Peptidaza Do homo24mer, E.Coli
Identifikatori
EC broj3.4.21.107
CAS broj161108-11-8
Baze podataka
IntEnzIntEnz pregled
BRENDABRENDA pristup
ExPASyNiceZyme pregled
KEGGKEGG pristup
MetaCycmetabolički put
PRIAMprofil
Strukture PBPRCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Ovaj enzim deluje na supstrate koji su bar delimično denaturisani. P1 ostatak mesta razlaganje je normalno između para hidrofobnih ostataka, kao što su Val-Val

Ova serinska endopeptidaza je esencijalna za razlaganje denaturisanih ili agregiranih proteina sa unutrašnje membrane i periplazmičnog prostora u Escherichia coli.

Reference

uredi
  1. ^ Lipinska, B., Zylicz, M. and Georgopoulos, C. (1990). „The HtrA (DegP) protein, essential for Escherichia coli survival at high temperatures, is an endopeptidase”. J. Bacteriol. 172: 1791—1797. PMID 2180903. 
  2. ^ Seol, J.H., Woo, S.K., Jung, E.M., Yoo, S.J., Lee, C.S., Kim, K.J., Tanaka, K., Ichihara, A., Ha, D.B. and Chung, C.H. (1991). „Protease Do is essential for survival of Escherichia coli at high temperatures: its identity with the htrA gene product”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 176: 730—736. PMID 2025286. 
  3. ^ Jones, C.H., Dexter, P., Evans, A.K., Liu, C., Hultgren, S.J. and Hruby, D.E. (2002). Escherichia coli DegP protease cleaves between paired hydrophobic residues in a natural substrate: the PapA pilin”. J. Bacteriol. 184: 5762—5771. PMID 12270835. 
  4. ^ Swamy, K.H., Chung, C.H. and Goldberg, A.L. (1983). „Isolation and characterization of protease Do from Escherichia coli, a large serine protease containing multiple subunits”. Arch. Biochem. Biophys. 224: 543—554. PMID 6347072. 
  5. ^ Pallen, M.J. & Wren, B.W. (1997). „The HtrA family of serine proteases”. Mol. Microbiol. 26: 209—221. PMID 9383148. 
  6. ^ Krojer, T., Garrido-Franco, M., Huber, R., Ehrmann, M. and Clausen, T. (2002). „Crystal structure of DegP (HtrA) reveals a new protease-chaperone machine”. Nature. 416: 455—459. PMID 11919638. 

Literatura

uredi

Spoljašnje veze

uredi