Beta-porfiranaza
Beta-porfiranaza (EC 3.2.1.178, porfiranaza, PorA, PorB, endo-beta-porfiranaza) je enzim sa sistematskim imenom porfiran beta-D-galaktopiranoza-(1->4)-alfa-L-galaktopiranoza-6-sulfat 4-glikanohidrolaza.[1][2] Ovaj enzim katalizuje sledeću hemijsku reakciju
Beta-porfiranaza | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||
EC broj | 3.2.1.178 | ||||||||
Baze podataka | |||||||||
IntEnz | IntEnz pregled | ||||||||
BRENDA | BRENDA pristup | ||||||||
ExPASy | NiceZyme pregled | ||||||||
KEGG | KEGG pristup | ||||||||
MetaCyc | metabolički put | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
Strukture PBP | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum | ||||||||
|
- hidroliza beta-D-galaktopiranoza-(1->4)-alfa-L-galaktopiranoza-6-sulfatnih veza u porfiranu
Osnova porfirana se uglavnom (~70%) sastoji od (1->3)-vezane beta-D-galaktopiranoze kojoj sledi (1->4)-vezana alfa-L-galaktopiranoza-6-sulfat [drugih 30% su uglavnom agarobiozne ponavljajuće jedinice (1->3)-vezane beta-D-galaktopiranoze kojoj sledi (1->4)-vezana 3,6-anhidro-alfa-L-galaktopiranoza]. Ovaj enzim razlaže (1->4) veze između beta-D-galaktopiranoze i alfa-L-galaktopiranoza-6-sulfata, i uglavnom formira disaharid alfa-L-galaktopiranoza-6-sulfat-(1->3)-beta-D-galaktozu, mada neki duži oligosaharidi sa parnim brojem ostataka su takođe mogući.
Reference
уреди- ^ Hehemann, J.H., Correc, G., Barbeyron, T., Helbert, W., Czjzek, M. and Michel, G. (2010). „Transfer of carbohydrate-active enzymes from marine bacteria to Japanese gut microbiota”. Nature. 464: 908—912. PMID 20376150.
- ^ Correc, G., Hehemann, J.H., Czjzek, M. and Helbert, W. (2011). „Structural analysis of the degradation products of porphyran digested by Zobellia galactanivorans β-porphyranase A”. Carbohydrate Polymers. 83: 277—283.
Literatura
уреди- Nicholas C. Price; Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third изд.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
- Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 изд.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
- Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0.
- Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 изд.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097.
Spoljašnje veze
уреди- Beta-porphyranase на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)